RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kndc1Q0KK55 1742 aa28.23■■■□□ 2.11
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmc2Q8R4P4 888 aa28.14■■■□□ 2.1
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Cyp7a1Q64505 503 aa28.13■■■□□ 2.09
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Top1mtQ8R4U6 593 aa28.01■■■□□ 2.07
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa28.01■■■□□ 2.07
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rad50P70388 1312 aa28.01■■■□□ 2.07
Suds3-201ENSMUST00000086471 Golim4Q8BXA1 655 aa28.01■■■□□ 2.07
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa28■■■□□ 2.07
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sh3bp5Q9Z131 463 aa28■■■□□ 2.07
Suds3-201ENSMUST00000086471 Bin2D3Z6Q9 489 aa27.99■■■□□ 2.07
Suds3-201ENSMUST00000086471 Hoxa7P02830 229 aa27.99■■■□□ 2.07
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rnf123Q5XPI3 1314 aa27.99■■■□□ 2.07
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Ciao1Q99KN2 339 aa27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 83.4 ms