RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 FZD4Q9ULV1 537 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM72A0PK05 275 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CD8B2A6NJW9 211 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM227AF5H4B4 570 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 KERAO60938 352 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DGAT1O75907 488 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GDF11O95390 407 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB3DO95716 219 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PMP2P02689 132 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CD8BP10966 210 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 EPXP11678 715 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 IL2RBP14784 551 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PAX1P15863 534 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CD86P42081 329 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR1E2P47887 323 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 LHX1P48742 406 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRISP1P54107 249 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPIBQ01892 262 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TCP10Q12799 353 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GAB1Q13480 694 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PKDCCQ504Y2 493 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CPXM2Q8N436 756 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DUSP16Q9BY84 665 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHST5Q9GZS9 411 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TBC1D17Q9HA65 648 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NRXN2Q9P2S2 1712 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DOCK5Q9H7D0 1870 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 YDJCA8MPS7 323 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 H0YCG3 227 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TLR4O00206 839 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 EREGO14944 169 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC28A2O43868 658 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MPZL2O60487 215 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GASTP01350 101 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TYRP14679 529 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 HLA-DPA1P20036 260 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 THBS2P35442 1172 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR1G1P47890 313 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 HCCSP53701 268 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADPRHP54922 357 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 F2RL1P55085 397 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PKIAP61925 76 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 HMGCS1Q01581 520 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NHLH2Q02577 135 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNLSQ5VYX0 342 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MFSD14CQ5VZR4 134 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC35F5Q8WV83 523 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OSTF1Q92882 214 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB3CQ96E17 227 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MASTLQ96GX5 879 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PINK1Q9BXM7 581 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 COA1Q9GZY4 146 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 LAT2Q9GZY6 243 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MFFQ9GZY8 342 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 LINC00597Q9H2U6 94 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.46□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A1B0GUH1 482 aa6.46□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 A6NLC8 198 aa6.46□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GABRPO00591 440 aa6.46□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 IFNA10P01566 189 aa6.46□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ICAM1P05362 532 aa6.46□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NPSP0C0P6 89 aa6.46□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PAX6P26367 422 aa6.46□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADRA1AP35348 466 aa6.46□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms