RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 VAT1LQ9HCJ6 419 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CELA1Q9UNI1 258 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 MGAT4BQ9UQ53 548 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CUX2O14529 1486 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 PARD3Q8TEW0 1356 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 A0A0U1RQV5 110 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 SAGE2PA6NJ88 616 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ZFP92A6NM28 416 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 LRRC30A6NM36 301 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 E9PLD3 99 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 VPS26AO75436 327 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ZNF254O75437 659 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ANXA3P12429 323 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 UQCRBP14927 111 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 RGRP47804 291 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 OR3A4PP47883 348 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 GPC3P51654 580 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 HSF2Q03933 536 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ZNF154Q13106 437 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 DPYSQ14117 519 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 KCNJ11Q14654 390 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 TEX44Q53QW1 395 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ZNF544Q6NX49 715 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 SCYL2Q6P3W7 929 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 SYVN1Q86TM6 617 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 VASH2Q86V25 355 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 PRR22Q8IZ63 422 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 STKLD1Q8NE28 680 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 TMEM80Q96HE8 168 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 LPAR2Q9HBW0 351 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ATXN10Q9UBB4 475 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 L3MBTL1Q9Y468 752 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 LRRK1Q38SD2 2015 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CHD4Q14839 1912 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 NISCHQ9Y2I1 1504 aa3.03□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ATRXP46100 2492 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 CCDC7Q96M83 1385 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 EPOPA6NHQ4 379 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 FAM74A7A6NL05 159 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 HDAC3O15379 428 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 AKR7A3O95154 331 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 UGT1A3P35503 534 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 PTGFRP43088 359 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 GNPDA1P46926 289 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 TRPC1P48995 793 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 LIM2P55344 173 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 OSTNP61366 133 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 RPL32P62910 135 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 RPL8P62917 257 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 TRIP10Q15642 601 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 FAM74A3Q4VXF1 159 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 UNC5DQ6UXZ4 953 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 IFNEQ86WN2 208 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 CEND1Q8N111 149 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 OR2T33Q8NG76 320 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 ARNTL2Q8WYA1 636 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 PSMG2Q969U7 264 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 HPDLQ96IR7 371 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 VPS39Q96JC1 886 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 B3GALT6Q96L58 329 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 MAGEB18Q96M61 343 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 C19orf24Q9BVV8 132 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 GALPQ9UBC7 116 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 ABCG2Q9UNQ0 655 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 CA5BQ9Y2D0 317 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 PPIAL4AQ9Y536 164 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 GMPPBQ9Y5P6 360 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 AP4B1Q9Y6B7 739 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 NCAPD2Q15021 1401 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 BICRAQ9NZM4 1560 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 OR7A17O14581 309 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 LANCL1O43813 399 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 SCGB2A1O75556 95 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 STX11O75558 287 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 SCRG1O75711 98 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 LYPD3O95274 346 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 ANP32DO95626 131 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 CD55P08174 381 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 THRBP10828 461 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 ZP3P21754 424 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 CCND2P30279 289 aa3.01□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms