RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089245.6

Shq1-201, Transcript of Protein SHQ1 homolog, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Shq1, Length 1,638 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1-201ENSMUST00000089245 CckbrP56481 453 aa17.54■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rps26P62855 115 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Repin1Q5U4E2 545 aa17.54■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Olfr1307Q7TQX1 312 aa17.54■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Prr5Q812A5 387 aa17.54■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Peli2Q8BST6 419 aa17.54■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Nadk2Q8C5H8 452 aa17.54■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Lyrm4Q8K215 91 aa17.54■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Klhl25Q8R2P1 589 aa17.54■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Olfr183Q8VFB9 309 aa17.54■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tmed10Q9D1D4 219 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Yae1d1Q9DAY6 216 aa17.54■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tceal6Q9DB24 200 aa17.54■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Elovl4Q9EQC4 312 aa17.54■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ighv15-2A0A0A6YX72 118 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Vmn2r125D3Z3M1 369 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Zfp605E9QAH2 694 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Kbtbd7G5E8C2 690 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Grpel2O88396 224 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Olfr13P34984 310 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pax7P47239 503 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ccr2P51683 373 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cds1P98191 461 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ube2fbQ3UWQ3 185 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Runx1t1Q61909 577 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Serpina3aQ6P4P1 422 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Orai3Q6P8G8 290 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Trim45Q6PFY8 580 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Zar1Q80SU3 361 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Slc34a3Q80SU6 601 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Catsper4Q8BVN3 442 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mterf4Q8BVN4 346 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dclre1bQ8C7W7 541 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Emc1Q8C7X2 997 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm5111Q8C9M4 190 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Q8CIL4 281 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Fmo2Q8K2I3 535 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 ScgnQ91WD9 276 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Diras1Q91Z61 198 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ndufab1Q9CR21 156 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tvp23bQ9D8T4 205 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dpep3Q9DA79 493 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 AcoxlQ9DBS4 632 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Inpp5eQ9JII1 647 aa17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 AtrxQ61687 2476 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ces2hF6Z9B9 558 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Slc16a5G5E8K6 468 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cacng1O70578 223 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ankrd42Q3V096 527 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Kcnh1Q60603 989 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Grb10Q60760 621 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Abcb7Q61102 752 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 IppkQ6P1C1 489 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cdc73Q8JZM7 531 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Fbxo45Q8K3B1 286 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Agr3Q8R3W7 165 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gdap1l1Q8VE33 370 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Olfr340Q8VGL0 312 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tmem159Q922Z1 161 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sfxn2Q925N2 322 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Def8Q99J78 448 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Slc6a19Q9D687 634 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Phyhd1Q9DB26 291 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 RelnQ60841 3461 aa17.52■□□□□ 0.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ubr5Q80TP3 2792 aa17.52■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Trav1A0A075B5Z4 110 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm14147A2AQX6 640 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Slc25a25A2ASZ8 469 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Slc27a6E9Q9W4 619 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 C3ar1O09047 477 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 ColqO35348 457 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 TP20293 436 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 BdnfP21237 249 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Nkx2-2P42586 273 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Shox2P70390 331 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Msx2Q03358 267 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pum2Q80U58 1066 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Snx32Q80ZJ7 404 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Asrgl1Q8C0M9 326 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dnajc27Q8CFP6 273 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Stx5Q8K1E0 355 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rnf130Q8VEM1 419 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sorcs3Q8VI51 1219 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Oas3Q8VI93 1138 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 PsphQ99LS3 225 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Chmp1b1Q99LU0 199 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tex29Q9DA77 186 aa17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rtp4Q9ER80 249 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Slc25a34A2ADF7 318 aa17.5■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Olfr1153A2AVC0 318 aa17.5■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm15155B1B034 138 aa17.5■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Zfp946F6VWU8 523 aa17.5■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Zfp141G3UY09 685 aa17.5■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Zfp212G3X8R7 492 aa17.5■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 TpmtO55060 240 aa17.5■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Kcnk2P97438 426 aa17.5■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 PamP97467 979 aa17.5■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 B4galnt1Q09200 533 aa17.5■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cyp2j13Q3UNV4 503 aa17.5■□□□□ 0.39
Shq1-201ENSMUST00000089245 MyrfQ3UR85 1138 aa17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.5 ms