RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 RNF148Q8N7C7 305 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ZNF321PQ8N8H1 164 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 NFKBIDQ8NI38 313 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 FIG4Q92562 907 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 OMA1Q96E52 524 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 RNF32Q9H0A6 362 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ING2Q9H160 280 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 YY1AP1Q9H869 796 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.6□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 SEC14L3Q9UDX4 400 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 POMPQ9Y244 141 aa8.6□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 EXPH5Q8NEV8 1989 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 DSPPQ9NZW4 1301 aa8.59□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 A0A1W2PQD3 144 aa8.59□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 ARGFXA6NJG6 315 aa8.59□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 SCDO00767 359 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ACOT8O14734 319 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ARPC2O15144 300 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 KIAA0513O60268 411 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 TSPAN2O60636 221 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 OR2J2O76002 312 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 PDE5AO76074 875 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CAPNS1P04632 268 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ITGB2P05107 769 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 GPIP06744 558 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ITGAMP11215 1152 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 UQCRBP14927 111 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 IL7RP16871 459 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 TBXA2RP21731 343 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 ADH7P40394 386 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CYB561P49447 251 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 HLCSP50747 726 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CASP9P55211 416 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ACTR3P61158 418 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 KCNJ2P63252 427 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SELENOWP63302 87 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ZNF141Q15928 474 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 NTRK2Q16620 822 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 LIN52Q52LA3 116 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ZFP1Q6P2D0 407 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 NPSR1Q6W5P4 371 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 RTL4Q6ZR62 310 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CBLL1Q75N03 491 aa8.59□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 MAL2Q969L2 176 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 TMBIM1Q969X1 311 aa8.59□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 MAGIXQ9H6Y5 334 aa8.59□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa8.59□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 NID1P14543 1247 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 ITGA2P17301 1181 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 MSX1P28360 303 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 IFNA8P32881 189 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 SOX11P35716 441 aa8.58□□□□□ -1.04
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