RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 GABRA1P14867 456 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 GABRA3P34903 492 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 PTGER4P35408 488 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 PHC1P78364 1004 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 OCRLQ01968 901 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 STX3Q13277 289 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 CASP8Q14790 479 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 DECR1Q16698 335 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 CPTPQ5TA50 214 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 NAXEQ8NCW5 288 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 OR2M3Q8NG83 312 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 OR5P2Q8WZ92 322 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 EQTNQ9NQ60 294 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 FBXO34Q9NWN3 711 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 POLQO75417 2590 aa14.83□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 A0A1W2PRB8 838 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 AHRRA9YTQ3 701 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 ACTL6AO96019 429 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 NGFRP08138 427 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 CPN1P15169 458 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 GPC1P35052 558 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 LHX2P50458 406 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRR5P85299 388 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 GRAMD1BQ3KR37 738 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 NATD1Q8N6N6 113 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARL8AQ96BM9 186 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPP1R36Q96LQ0 422 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 NUF2Q9BZD4 464 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 UCK2Q9BZX2 261 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 EXO5Q9H790 373 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 GIN1Q9NXP7 522 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF195O14628 629 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCNK2O95069 426 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 UTS2O95399 124 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 C6orf47O95873 294 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 MSX1P28360 303 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 KRT20P35900 424 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLDN18P56856 261 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 HBA1P69905 142 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM44Q2T9K0 475 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 HHATQ5VTY9 493 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 OR5M10Q6IEU7 315 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAVSQ7Z434 540 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 FBXO30Q8TB52 745 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 SFXN5Q8TD22 340 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 GPR151Q8TDV0 419 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 UCN2Q96RP3 112 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 STACQ99469 402 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 DUSP26Q9BV47 211 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 DUSP22Q9NRW4 184 aa14.81□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 CREBBPQ92793 2442 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 CD8B2A6NJW9 211 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 ALG1L2C9J202 215 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 SCO2O43819 266 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF708P17019 499 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 TIMP3P35625 211 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLDN15P56746 228 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDC73Q6P1J9 531 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 MARCH3Q86UD3 253 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRIM42Q8IWZ5 723 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNIP2Q8NFZ5 429 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 OR4C3Q8NH37 302 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 TESCQ96BS2 214 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 C3orf14Q9HBI5 128 aa14.8□□□□□ -0.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 NEUROD4Q9HD90 331 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms