RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 CANT1Q8WVQ1 401 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 PYDC1Q8WXC3 89 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 DOHHQ9BU89 302 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXD1Q9GZZ0 328 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC13A4Q9UKG4 626 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM200CA6NKL6 621 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 MASP2O00187 686 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 DBIP07108 87 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADRB1P08588 477 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL7RP16871 459 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 LCN1P31025 176 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMED10P49755 219 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 RRADP55042 308 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF311Q5JNZ3 666 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 AAGABQ6PD74 315 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENPP6Q6UWR7 440 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 HMGN2P46Q86SG4 172 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC15A4Q8N697 577 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 PROX1Q92786 737 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC47A1Q96FL8 570 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADOQ96SZ5 270 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 NKX2-8O15522 239 aa25.29■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2J2O76002 312 aa25.29■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HPGDP15428 266 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC7A1P30825 629 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRYBA2P53672 197 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q0VFX4 171 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZAR1Q86SH2 424 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADGRG5Q8IZF4 528 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF527Q8NB42 609 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSH2DQ96JZ2 352 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDCP1Q9H5V8 836 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPTBN2O15020 2390 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGAP5A6NIR3 686 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPIPA7E9PJI5 369 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPIPA8P0DM63 369 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCTP40126 519 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 PNLIPRP2P54317 469 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP12AP54707 1039 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHAF1BQ13112 559 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBCELQ5QJ74 424 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 AP1ARQ63HQ0 302 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF614Q8N883 585 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZG16BQ96DA0 208 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 PINK1Q9BXM7 581 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARMC7Q9H6L4 198 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAGIXQ9H6Y5 334 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 S100A14Q9HCY8 104 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 AP4S1Q9Y587 144 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSPAN2O60636 221 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCB7O75027 752 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGA10O75578 1167 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT36O76013 467 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 THBS1P07996 1170 aa25.27■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGA3P26006 1051 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFR3AQ14156 821 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 LIN52Q52LA3 116 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFI44LQ53G44 452 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 VTCN1Q7Z7D3 282 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 VRK2Q86Y07 508 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM86B1Q8N7N1 296 aa25.27■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-201ENST00000318988 YY1AP1Q9H869 796 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-201ENST00000318988 POLHQ9Y253 713 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR6C70A6NIJ9 312 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 MGRN1O60291 552 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPM1BO75688 479 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 UGT2B17O75795 530 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 UTS2O95399 124 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAP2AP10114 183 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRKAR1BP31321 381 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNJ5P48544 419 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 DUSP7Q16829 419 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCRLBQ6BAA4 426 aa25.27■■□□□ 1.64
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