RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa16.11■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 GALNT9Q9HCQ5 603 aa16.11■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 ZSCAN32Q9NX65 697 aa16.11■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 ASB4Q9Y574 426 aa16.11■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 FABP7O15540 132 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 HOXA9P31269 272 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 CDK3Q00526 305 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 ASB12Q8WXK4 309 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 MACROD1Q9BQ69 325 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 UPB1Q9UBR1 384 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 SNX11Q9Y5W9 270 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 CACNG2Q9Y698 323 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 CSO75390 466 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 OR12D2P58182 307 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 RAB40BQ12829 278 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 TOMM20Q15388 145 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 NXPE4Q6UWF7 544 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 OR51A7Q8NH64 312 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 KLHL21Q9UJP4 597 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 GNG8Q9UK08 70 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 UPK1AO00322 258 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 HTR1AP08908 422 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 CD3GP09693 182 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 NDUFV2P19404 249 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 ADAM8P78325 824 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 POMGNT2Q8NAT1 580 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 ELMOD3Q96FG2 381 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 FAM83CQ9BQN1 747 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 OR10A4Q9H209 315 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 MED31Q9Y3C7 131 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 NINQ8N4C6 2090 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 SDC3O75056 442 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 PLATP00750 562 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 PSPHP78330 225 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 PON3Q15166 354 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 COX20Q5RI15 118 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 PLBD1Q6P4A8 553 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 CYHR1Q6ZMK1 362 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 CAMKVQ8NCB2 501 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 SLC6A16Q9GZN6 736 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 ASIC5Q9NY37 505 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1B0GVI7 797 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 HYKKA2RU49 373 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 NCR1O76036 304 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 ECDO95905 644 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 INHBBP09529 407 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 ARAFP10398 606 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 ACPPP15309 386 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 PCMT1P22061 227 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 RPS25P62851 125 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 EFR3AQ14156 821 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 ZMYND11Q15326 602 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 GGTA1PQ4G0N0 100 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 TMED4Q7Z7H5 227 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 CPOQ8IVL8 374 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 TMIEQ8NEW7 156 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 SUN3Q8TAQ9 357 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF480Q8WV37 535 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 NR4A3Q92570 626 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 HHIPQ96QV1 700 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 ACTL8Q9H568 366 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 GMEB2Q9UKD1 530 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 FMO6PO60774 539 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 RAB28P51157 221 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 ADIPOR2Q86V24 386 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 OR52E4Q8NGH9 312 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 SAP130Q9H0E3 1048 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 LMAN1LQ9HAT1 526 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 CKLFQ9UBR5 152 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 B8ZZF3 427 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 RAB3BP20337 219 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 ARFIP1P53367 373 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF852Q6ZMS4 543 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 CREB3L2Q70SY1 520 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 PAQR7Q86WK9 346 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 SLC44A3Q8N4M1 653 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 L3MBTL4Q8NA19 623 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 IL17RDQ8NFM7 739 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 DPYSL5Q9BPU6 564 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 MUTYHQ9UIF7 546 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 CACNA1CQ13936 2221 aa16.09■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 OR2AT4A6NND4 320 aa16.08■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 H3BSH0 61 aa16.08■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 SCN2BO60939 215 aa16.08■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 VNN2O95498 520 aa16.08■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 PDGFAP04085 211 aa16.08■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF806P0C7X5 589 aa16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms