RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055506.8

Gtf3c1-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c1, Length 6,961 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Csnk2a1Q60737 391 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1031Q7TR87 336 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tm9sf4Q8BH24 643 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fem1abQ8C0T1 654 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cpne5Q8JZW4 593 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr283Q8VGU2 309 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gbgt1Q8VI38 347 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pin1Q9QUR7 165 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm10608E9PZ13 166 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn1r76F8VQ63 324 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn2r99H3BK37 856 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 P06335 190 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Hoxb5P09079 269 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rab5cP35278 216 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cxcr4P70658 359 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Lrrc74bQ14BP6 391 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmem102Q3UPR7 509 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 PigaQ64323 485 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1307Q7TQX1 312 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nudt15Q8BG93 170 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Synpo2lQ8BWB1 975 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 GabrpQ8QZW7 440 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 MynnQ99MD8 610 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Copz2Q9JHH9 205 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Kcnmb4Q9JIN6 210 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 ClppO88696 272 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 KitlgP20826 273 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Hcrtr2P58308 460 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tarbp2P97473 365 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Q3V0E1 1183 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Kdelr2Q9CQM2 212 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 CutalQ9D1U5 156 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Hyal6Q9D4E9 494 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Adat1Q9JHI2 499 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Usp18Q9WTV6 368 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 TfecQ9WTW4 317 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm31371A0A1D5RM70 265 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cilp2D3Z7H8 1162 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr773F6VS78 311 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rab11bP46638 218 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 CtnsP57757 367 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 SstP60041 116 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 UbqlnlQ14DL0 610 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rhox4gQ2MDF7 205 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rhox4dQ2MDG0 205 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Milr1Q3TB92 246 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rhox4eQ504P9 205 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Patz1Q5NBY9 687 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 H2-M2Q6W9L1 343 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Methig1Q76I26 264 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gpr142Q7TQN9 365 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mapk15Q80Y86 549 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr772Q8VGC5 311 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vsx1Q91V10 363 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nrif1Q923B3 828 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Txnrd3Q99MD6 652 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Glo1Q9CPU0 184 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Creb3l4Q9D2A5 370 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rhox4bQ9JI43 205 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Actr10Q9QZB7 417 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Spint1Q9R097 507 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm21560D3Z7A4 205 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm3138K7N754 218 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rack1P68040 317 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Il10rbQ61190 349 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Lyrm4Q8K215 91 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr970Q8VFN3 311 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr380Q8VGT3 311 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rnf111Q99ML9 989 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Acss1Q99NB1 682 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pabpc4lG5E8X2 370 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dsg2O55111 1122 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 FiglaO55208 194 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 NfkbidQ2TB02 327 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 CalcrQ60755 533 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cr1lQ64735 483 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Itln1bQ80ZA0 313 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Atg4bQ8BGE6 393 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sec22aQ8BH47 307 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nedd4lQ8CFI0 1004 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cox4i2Q91W29 172 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 ShpkQ9D5J6 476 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Elp4Q9ER73 422 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rsc1a1Q9ER99 582 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm10720D3Z1I5 223 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm8225D3Z536 292 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 F3P20352 294 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 MakQ04859 622 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cd300lfQ6SJQ7 337 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cdkl1Q8CEQ0 352 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gsto2Q8K2Q2 248 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Borcs7Q9CRC6 105 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Lcn9Q9D267 178 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Robo1O89026 1612 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 PpibP24369 216 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cdc25bP30306 576 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gabrr1P56475 480 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc30a2Q2HJ10 371 aa10.59□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Klhdc9Q3USL1 350 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 85.7 ms