Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Kcnmb4Q9JIN6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Kcnmb4Q9JIN6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Kcnmb4Q9JIN6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Kcnmb4Q9JIN6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kcnmb4Q9JIN6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Kcnmb4Q9JIN6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kcnmb4Q9JIN6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Kcnmb4Q9JIN6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Kcnmb4Q9JIN6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kcnmb4Q9JIN6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kcnmb4Q9JIN6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kcnmb4Q9JIN6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Kcnmb4Q9JIN6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kcnmb4Q9JIN6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcnmb4Q9JIN6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kcnmb4Q9JIN6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kcnmb4Q9JIN6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kcnmb4Q9JIN6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcnmb4Q9JIN6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Kcnmb4Q9JIN6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcnmb4Q9JIN6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcnmb4Q9JIN6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcnmb4Q9JIN6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kcnmb4Q9JIN6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kcnmb4Q9JIN6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Kcnmb4Q9JIN6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kcnmb4Q9JIN6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Kcnmb4Q9JIN6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kcnmb4Q9JIN6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kcnmb4Q9JIN6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kcnmb4Q9JIN6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kcnmb4Q9JIN6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kcnmb4Q9JIN6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kcnmb4Q9JIN6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Kcnmb4Q9JIN6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kcnmb4Q9JIN6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kcnmb4Q9JIN6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kcnmb4Q9JIN6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kcnmb4Q9JIN6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcnmb4Q9JIN6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kcnmb4Q9JIN6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kcnmb4Q9JIN6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcnmb4Q9JIN6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kcnmb4Q9JIN6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcnmb4Q9JIN6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kcnmb4Q9JIN6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kcnmb4Q9JIN6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kcnmb4Q9JIN6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kcnmb4Q9JIN6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kcnmb4Q9JIN6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kcnmb4Q9JIN6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kcnmb4Q9JIN6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Kcnmb4Q9JIN6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kcnmb4Q9JIN6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kcnmb4Q9JIN6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnmb4Q9JIN6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnmb4Q9JIN6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcnmb4Q9JIN6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcnmb4Q9JIN6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kcnmb4Q9JIN6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcnmb4Q9JIN6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcnmb4Q9JIN6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kcnmb4Q9JIN6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kcnmb4Q9JIN6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnmb4Q9JIN6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnmb4Q9JIN6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcnmb4Q9JIN6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcnmb4Q9JIN6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcnmb4Q9JIN6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcnmb4Q9JIN6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kcnmb4Q9JIN6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kcnmb4Q9JIN6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kcnmb4Q9JIN6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnmb4Q9JIN6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnmb4Q9JIN6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcnmb4Q9JIN6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnmb4Q9JIN6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnmb4Q9JIN6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnmb4Q9JIN6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcnmb4Q9JIN6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnmb4Q9JIN6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnmb4Q9JIN6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnmb4Q9JIN6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnmb4Q9JIN6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnmb4Q9JIN6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnmb4Q9JIN6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnmb4Q9JIN6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnmb4Q9JIN6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms