RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000202170.3

Pds5b-208, Transcript of Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Pds5b, Length 6,598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Slco3a1Q8R3L5 710 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Wdr45bQ9CR39 344 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Zcchc10Q9CX48 178 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Tmem35aQ9D328 167 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Zdhhc4Q9D6H5 343 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 AdgbG3UZ78 1657 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm21936A0A1Y7VJE9 144 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm5788A0A1Y7VK80 144 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm12790B1AUV6 201 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Prf1P10820 554 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rab11bP46638 218 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Hrh1P70174 488 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Vdac3Q60931 283 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 B4galt7Q8R087 327 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Oard1Q8R5F3 152 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr1309Q8VF83 320 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr535Q8VGL3 312 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Vsx1Q91V10 363 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ddx1Q91VR5 740 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Slc41a3Q921R8 488 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 CsprsQ99388 208 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ceacam20Q9D2Z1 577 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Alyref2Q9JJW6 218 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 ProdhQ9WU79 599 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Tcrg-C4A0A075B6C7 190 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm4858A0A0A6YWS7 318 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Vmn1r77E9PY60 306 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Vmn2r107E9PZJ7 861 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Fezf1Q0VDQ9 475 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Sox19Q62249 55 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Pramel5Q7TPY4 500 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rpp38Q80UU2 280 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Q8BPC6 396 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Thumpd1Q99J36 350 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ccdc107Q9DCC3 242 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 TrehQ9JLT2 576 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 PnckQ9QYK9 343 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr1112A2ATA0 318 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Tmem265E9Q8G3 109 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm21833J3QPK1 500 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Il12aP43431 215 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Acot8P58137 320 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Hepacam2Q4VAH7 463 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Cd300lfQ6SJQ7 337 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Got1l1Q7TSV6 404 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr799Q8VGI7 311 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Zfp982A2A8Q4 368 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm19965J3QNY8 723 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Alox8O35936 677 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Bcl2l11O54918 196 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 KitlgP20826 273 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Prr27Q3SYJ2 352 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Jagn1Q5XKN4 183 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Elavl3Q60900 367 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr1106Q7TR57 312 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Nedd4lQ8CFI0 1004 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Nmral1Q8K2T1 309 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Mfsd6lQ8R3N2 586 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rab28Q99KL7 221 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Exosc7Q9D0M0 291 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Isca2Q9DCB8 154 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rsc1a1Q9ER99 582 aa14.95□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rnaset2aC0HKG5 259 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rnaset2bC0HKG6 259 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Btbd16E9Q173 522 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Vmn2r105E9Q3A5 860 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr550E9Q544 316 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr730E9Q8M3 318 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gpr25P0C5I1 358 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Hoxb9P20615 250 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 CryaaP24622 196 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Slc27a5Q4LDG0 689 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr1307Q7TQX1 312 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Lipt1Q8VCM4 373 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Fam69aQ9D6I7 428 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Sult1b1Q9QWG7 299 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr424E9Q0Q2 315 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Crhr2Q60748 411 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gpr75Q6X632 540 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 TifaQ793I8 184 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Slc45a1Q8BIV7 751 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Zim1Q8C393 579 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Cpne5Q8JZW4 593 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 ManbaQ8K2I4 879 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr561Q8VGZ6 314 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Wdr45Q91VM3 360 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 IsxA1A546 240 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm3072F6SKY8 209 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm17654F7AXR3 209 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Btnl2O70355 454 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 1700057G04RikQ3V0U0 232 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Krt33bQ61897 404 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ssr4Q62186 172 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Vmn1r189Q8K3N3 312 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Vmn1r229Q8R2A9 306 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Macrod1Q922B1 323 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Nme7Q9QXL8 395 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm16432A0A0A6YXX9 775 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 TspearJ3S6Y1 670 aa14.94□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Bloc1s1O55102 125 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.3 ms