Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Sox19Q62249 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,64■■■□□ 2,18
Sox19Q62249 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Sox19Q62249 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Sox19Q62249 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Sox19Q62249 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Sox19Q62249 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Sox19Q62249 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Sox19Q62249 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Sox19Q62249 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Sox19Q62249 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Sox19Q62249 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Sox19Q62249 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Sox19Q62249 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
Sox19Q62249 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Sox19Q62249 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
Sox19Q62249 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Sox19Q62249 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Sox19Q62249 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Sox19Q62249 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Sox19Q62249 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Sox19Q62249 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Sox19Q62249 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Sox19Q62249 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
Sox19Q62249 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Sox19Q62249 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Sox19Q62249 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Sox19Q62249 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Sox19Q62249 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
Sox19Q62249 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Sox19Q62249 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Sox19Q62249 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Sox19Q62249 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Sox19Q62249 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Sox19Q62249 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25■■□□□ 1,59
Sox19Q62249 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Sox19Q62249 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Sox19Q62249 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Sox19Q62249 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Sox19Q62249 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Sox19Q62249 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Sox19Q62249 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Sox19Q62249 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,69■■□□□ 1,54
Sox19Q62249 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Sox19Q62249 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Sox19Q62249 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Sox19Q62249 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Sox19Q62249 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Sox19Q62249 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Sox19Q62249 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Sox19Q62249 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Sox19Q62249 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Sox19Q62249 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Sox19Q62249 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
Sox19Q62249 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Sox19Q62249 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Sox19Q62249 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Sox19Q62249 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Sox19Q62249 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Sox19Q62249 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,19■■□□□ 1,46
Sox19Q62249 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Sox19Q62249 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Sox19Q62249 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Sox19Q62249 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Sox19Q62249 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,11■■□□□ 1,45
Sox19Q62249 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Sox19Q62249 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Sox19Q62249 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Sox19Q62249 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Sox19Q62249 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Sox19Q62249 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Sox19Q62249 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Sox19Q62249 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Sox19Q62249 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Sox19Q62249 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,86■■□□□ 1,41
Sox19Q62249 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,85■■□□□ 1,41
Sox19Q62249 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Sox19Q62249 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Sox19Q62249 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Sox19Q62249 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Sox19Q62249 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Sox19Q62249 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Sox19Q62249 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Sox19Q62249 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Sox19Q62249 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Sox19Q62249 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Sox19Q62249 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,59■■□□□ 1,37
Sox19Q62249 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Sox19Q62249 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Sox19Q62249 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Sox19Q62249 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Sox19Q62249 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Sox19Q62249 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Sox19Q62249 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Sox19Q62249 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,38■■□□□ 1,33
Sox19Q62249 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Sox19Q62249 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Sox19Q62249 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Sox19Q62249 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Sox19Q62249 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,3 ms