Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
CsprsQ99388 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
CsprsQ99388 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
CsprsQ99388 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
CsprsQ99388 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
CsprsQ99388 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
CsprsQ99388 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
CsprsQ99388 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
CsprsQ99388 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
CsprsQ99388 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
CsprsQ99388 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
CsprsQ99388 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,49■■□□□ 1,83
CsprsQ99388 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
CsprsQ99388 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
CsprsQ99388 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
CsprsQ99388 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
CsprsQ99388 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
CsprsQ99388 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
CsprsQ99388 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
CsprsQ99388 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,91■■□□□ 1,74
CsprsQ99388 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
CsprsQ99388 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,76■■□□□ 1,71
CsprsQ99388 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,68■■□□□ 1,7
CsprsQ99388 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
CsprsQ99388 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
CsprsQ99388 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
CsprsQ99388 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
CsprsQ99388 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
CsprsQ99388 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
CsprsQ99388 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
CsprsQ99388 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
CsprsQ99388 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
CsprsQ99388 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
CsprsQ99388 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
CsprsQ99388 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
CsprsQ99388 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
CsprsQ99388 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,98■■□□□ 1,59
CsprsQ99388 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
CsprsQ99388 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
CsprsQ99388 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
CsprsQ99388 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
CsprsQ99388 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
CsprsQ99388 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
CsprsQ99388 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
CsprsQ99388 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
CsprsQ99388 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,82■■□□□ 1,56
CsprsQ99388 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
CsprsQ99388 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
CsprsQ99388 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
CsprsQ99388 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
CsprsQ99388 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
CsprsQ99388 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
CsprsQ99388 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
CsprsQ99388 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
CsprsQ99388 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
CsprsQ99388 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,55■■□□□ 1,52
CsprsQ99388 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
CsprsQ99388 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
CsprsQ99388 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
CsprsQ99388 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
CsprsQ99388 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
CsprsQ99388 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,33■■□□□ 1,49
CsprsQ99388 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
CsprsQ99388 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
CsprsQ99388 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
CsprsQ99388 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
CsprsQ99388 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
CsprsQ99388 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,08■■□□□ 1,45
CsprsQ99388 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
CsprsQ99388 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
CsprsQ99388 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
CsprsQ99388 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
CsprsQ99388 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,94■■□□□ 1,42
CsprsQ99388 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
CsprsQ99388 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,91■■□□□ 1,42
CsprsQ99388 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,88■■□□□ 1,41
CsprsQ99388 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
CsprsQ99388 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
CsprsQ99388 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
CsprsQ99388 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
CsprsQ99388 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
CsprsQ99388 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
CsprsQ99388 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,74■■□□□ 1,39
CsprsQ99388 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,68■■□□□ 1,38
CsprsQ99388 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
CsprsQ99388 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
CsprsQ99388 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
CsprsQ99388 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,58■■□□□ 1,37
CsprsQ99388 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
CsprsQ99388 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
CsprsQ99388 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
CsprsQ99388 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
CsprsQ99388 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
CsprsQ99388 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
CsprsQ99388 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
CsprsQ99388 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
CsprsQ99388 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
CsprsQ99388 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,41■■□□□ 1,34
CsprsQ99388 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
CsprsQ99388 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51,6 ms