Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T1

Nmral1, NmrA-like family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmral1Q8K2T1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,82■■■■□ 3
Nmral1Q8K2T1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Nmral1Q8K2T1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Nmral1Q8K2T1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Nmral1Q8K2T1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Nmral1Q8K2T1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Nmral1Q8K2T1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
Nmral1Q8K2T1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Nmral1Q8K2T1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,16■■■□□ 2,26
Nmral1Q8K2T1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Nmral1Q8K2T1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Nmral1Q8K2T1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Nmral1Q8K2T1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Nmral1Q8K2T1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Nmral1Q8K2T1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Nmral1Q8K2T1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Nmral1Q8K2T1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Nmral1Q8K2T1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Nmral1Q8K2T1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Nmral1Q8K2T1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Nmral1Q8K2T1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Nmral1Q8K2T1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Nmral1Q8K2T1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Nmral1Q8K2T1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Nmral1Q8K2T1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Nmral1Q8K2T1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Nmral1Q8K2T1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Nmral1Q8K2T1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Nmral1Q8K2T1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Nmral1Q8K2T1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Nmral1Q8K2T1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Nmral1Q8K2T1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Nmral1Q8K2T1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Nmral1Q8K2T1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Nmral1Q8K2T1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,32■■□□□ 1,96
Nmral1Q8K2T1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Nmral1Q8K2T1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Nmral1Q8K2T1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,2■■□□□ 1,94
Nmral1Q8K2T1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Nmral1Q8K2T1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Nmral1Q8K2T1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Nmral1Q8K2T1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Nmral1Q8K2T1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Nmral1Q8K2T1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Nmral1Q8K2T1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Nmral1Q8K2T1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,88
Nmral1Q8K2T1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Nmral1Q8K2T1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Nmral1Q8K2T1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Nmral1Q8K2T1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Nmral1Q8K2T1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Nmral1Q8K2T1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,59■■□□□ 1,85
Nmral1Q8K2T1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,57■■□□□ 1,84
Nmral1Q8K2T1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Nmral1Q8K2T1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Nmral1Q8K2T1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Nmral1Q8K2T1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Nmral1Q8K2T1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Nmral1Q8K2T1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Nmral1Q8K2T1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Nmral1Q8K2T1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Nmral1Q8K2T1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Nmral1Q8K2T1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Nmral1Q8K2T1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,17■■□□□ 1,78
Nmral1Q8K2T1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Nmral1Q8K2T1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Nmral1Q8K2T1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Nmral1Q8K2T1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,1■■□□□ 1,77
Nmral1Q8K2T1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Nmral1Q8K2T1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Nmral1Q8K2T1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Nmral1Q8K2T1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Nmral1Q8K2T1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Nmral1Q8K2T1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Nmral1Q8K2T1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Nmral1Q8K2T1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Nmral1Q8K2T1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Nmral1Q8K2T1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Nmral1Q8K2T1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Nmral1Q8K2T1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Nmral1Q8K2T1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Nmral1Q8K2T1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Nmral1Q8K2T1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Nmral1Q8K2T1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Nmral1Q8K2T1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Nmral1Q8K2T1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Nmral1Q8K2T1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Nmral1Q8K2T1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Nmral1Q8K2T1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Nmral1Q8K2T1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Nmral1Q8K2T1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Nmral1Q8K2T1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Nmral1Q8K2T1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Nmral1Q8K2T1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Nmral1Q8K2T1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Nmral1Q8K2T1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Nmral1Q8K2T1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Nmral1Q8K2T1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Nmral1Q8K2T1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nmral1Q8K2T1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms