RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SSX5O60225 188 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CNR1P21554 472 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ATP1B3P54709 279 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 KCNJ15Q99712 375 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 AIG1Q9NVV5 245 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 GPR83Q9NYM4 423 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SLIT2O94813 1529 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 DIP2BQ9P265 1576 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 DUX1O43812 170 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 IL33O95760 270 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ITGB2P05107 769 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CTXN2P0C2S0 81 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 KCNE1P15382 129 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ELK1P19419 428 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 KDELR2P33947 212 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 INCA1Q0VD86 236 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 DACT2Q5SW24 774 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 TAC4Q86UU9 113 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CD200R1Q8TD46 325 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 GRHL3Q8TE85 626 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SERINC2Q96SA4 455 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 RRAGCQ9HB90 399 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 MOKQ9UQ07 419 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 VILLO15195 856 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PCGF2P35227 344 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SGK3Q96BR1 496 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PREBQ9HCU5 417 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ADH5P11766 374 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 BMP1P13497 986 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 BMI1P35226 326 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 NFATC3Q12968 1075 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ADGRB2O60241 1585 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 J3KR12 359 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PSMD9O00233 223 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 KIAA0355O15063 1070 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 RAB3DO95716 219 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 LCN6P62502 163 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 NDUFAF7Q7L592 441 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PDZD3Q86UT5 571 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 UEVLDQ8IX04 471 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 KDM8Q8N371 416 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 POLLQ9UGP5 575 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 BCORL1Q5H9F3 1711 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PRAMEF11O60813 436 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 S1PR4O95977 384 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 GALTP07902 379 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CPOXP36551 454 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 DGKQP52824 942 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SLC7A9P82251 487 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 H3F3AP84243 136 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 GALEQ14376 348 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 C6orf183Q5T699 404 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 NOXRED1Q6NXP6 359 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 FAM129CQ86XR2 697 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 C12orf42Q96LP6 360 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 MED18Q9BUE0 208 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms