RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 TRPC4Q9UBN4 977 aa16.21■□□□□ 0.19
PRRT4-205ENST00000489835 EPHA6Q9UF33 1036 aa16.21■□□□□ 0.19
PRRT4-205ENST00000489835 ISPDA4D126 451 aa16.2■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 HMGN4O00479 90 aa16.2■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
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PRRT4-205ENST00000489835 OR12D1P0DN82 309 aa16.2■□□□□ 0.18
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PRRT4-205ENST00000489835 C11orf74Q86VG3 221 aa16.2■□□□□ 0.18
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PRRT4-205ENST00000489835 NUDT22Q9BRQ3 303 aa16.2■□□□□ 0.18
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PRRT4-205ENST00000489835 FAHD1Q6P587 224 aa16.2■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
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PRRT4-205ENST00000489835 SLC38A4Q969I6 547 aa16.2■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 C16orf58Q96GQ5 468 aa16.2■□□□□ 0.18
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PRRT4-205ENST00000489835 TMEM229AB2RXF0 380 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 CHST10O43529 356 aa16.19■□□□□ 0.18
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PRRT4-205ENST00000489835 ERV3-1Q14264 604 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 CARTPTQ16568 116 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF181Q2M3W8 571 aa16.19■□□□□ 0.18
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PRRT4-205ENST00000489835 PITX2Q99697 317 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 CTRCQ99895 268 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 RAB33BQ9H082 229 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 MMP27Q9H306 513 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 MS4A12Q9NXJ0 267 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 HYKKA2RU49 373 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 OR2W5A6NFC9 320 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 AIREO43918 545 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 DPM1O60762 260 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
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PRRT4-205ENST00000489835 STEAP3Q658P3 488 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 TUBA1AQ71U36 451 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 AKAP14Q86UN6 197 aa16.19■□□□□ 0.18
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PRRT4-205ENST00000489835 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 EID2Q8N6I1 236 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 POC5Q8NA72 575 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 SEMA3GQ9NS98 782 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 GMEB2Q9UKD1 530 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 RAB23Q9ULC3 237 aa16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa16.18■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 AGAP5A6NIR3 686 aa16.18■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 TAF4O00268 1085 aa16.18■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 DLGAP3O95886 979 aa16.18■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 UGT2B10P36537 528 aa16.18■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 GPR3P46089 330 aa16.18■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 ARL4DP49703 201 aa16.18■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 SYPL1Q16563 259 aa16.18■□□□□ 0.18
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
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