RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 SLC24A3Q9HC58 644 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 IRAK4Q9NWZ3 460 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 REV1Q9UBZ9 1251 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 MKLN1Q9UL63 735 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 HYKKA2RU49 373 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 STX11O75558 287 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 NSA2O95478 260 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 THBS1P07996 1170 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 CCNYL3P0C7X3 344 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 GABRB1P18505 474 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 POU1F1P28069 291 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 IFNGR2P38484 337 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 GABRA4P48169 554 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 DUSP8Q13202 625 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 EIPR1Q53HC9 387 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 CD300LDQ6UXZ3 194 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 ZNF595Q8IYB9 648 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 ZNF619Q8N2I2 560 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 COX18Q8N8Q8 333 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 SIMC1Q8NDZ2 872 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 CTHRC1Q96CG8 243 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 ZG16BQ96DA0 208 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 ZNF350Q9GZX5 532 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 ANKRD19PQ9H560 264 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 UCKL1Q9NWZ5 548 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 HCN3Q9P1Z3 774 aa15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 AP3D1O14617 1153 aa15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 FOXS1O43638 330 aa15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 GSTM3P21266 225 aa15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 AVPR1BP47901 424 aa15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 GFERP55789 205 aa15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 ST3GAL3Q11203 375 aa15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 MAP4K2Q12851 820 aa15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 TRAM2Q15035 370 aa15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 DCST2Q5T1A1 773 aa15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 AHSA2Q719I0 299 aa15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 TMEM105Q8N8V8 129 aa15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 OR4K5Q8NGD3 323 aa15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 PMM1Q92871 262 aa15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 COPS4Q9BT78 406 aa15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 RNF215Q9Y6U7 377 aa15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.85■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 SH3D21A4FU49 640 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 CLCA1A8K7I4 914 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 CLDN4O14493 209 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 CTNSO60931 367 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 CYP7B1O75881 506 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 INMTO95050 263 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 DBIP07108 87 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 CT62P0C5K7 136 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 ALDH4A1P30038 563 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 CNR2P34972 360 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 STX4Q12846 297 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 SLC13A2Q13183 592 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 SLX4IPQ5VYV7 408 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 PTCHD4Q6ZW05 846 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 CCDC103Q8IW40 242 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 SHISA5Q8N114 240 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 CARFQ8N187 725 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 VWA5B2Q8N398 1253 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 CLIP4Q8N3C7 705 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 MORN4Q8NDC4 146 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 GPR151Q8TDV0 419 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 DOK4Q8TEW6 326 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 SAP130Q9H0E3 1048 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 POLE3Q9NRF9 147 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 CLN6Q9NWW5 311 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 LRIT1Q9P2V4 623 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 TMEM131Q92545 1883 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 CCDC88CQ9P219 2028 aa15.84■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa15.83■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 TRIM64BA6NI03 449 aa15.83■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 AGAP5A6NIR3 686 aa15.83■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 H3BN98 237 aa15.83■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 TPST2O60704 377 aa15.83■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 ATE1O95260 518 aa15.83■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 MED26O95402 600 aa15.83■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 CCNA2P20248 432 aa15.83■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 MAP3K8P41279 467 aa15.83■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 MAP2K4P45985 399 aa15.83■□□□□ 0.13
SSR4-201ENST00000320857 FNTBP49356 437 aa15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms