RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 DGKEP52429 567 aa20.15■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 UGT2B15P54855 530 aa20.15■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 BNC1Q01954 994 aa20.15■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 C1orf61Q13536 156 aa20.15■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 LTB4RQ15722 352 aa20.15■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 PROX2Q3B8N5 592 aa20.15■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 FRMPD2BQ6IN97 320 aa20.15■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 BHLHB9Q6PI77 547 aa20.15■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 TAF8Q7Z7C8 310 aa20.15■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 OR4N4Q8N0Y3 316 aa20.15■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 OR4D11Q8NGI4 311 aa20.15■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 APH1BQ8WW43 257 aa20.15■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 RLN3Q8WXF3 142 aa20.15■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 ZNF354BQ96LW1 612 aa20.15■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 ACOXLQ9NUZ1 547 aa20.15■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.15■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 SEMA7AO75326 666 aa20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 NME6O75414 186 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 WBP4O75554 376 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 CCR5P51681 352 aa20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 HMGA2P52926 109 aa20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 FUT5Q11128 374 aa20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 AHSA2Q719I0 299 aa20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 NRARPQ7Z6K4 114 aa20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 CCDC190Q86UF4 302 aa20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 AQP11Q8NBQ7 271 aa20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 OR56A1Q8NGH5 318 aa20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 SLC37A2Q8TED4 501 aa20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 KAT2AQ92830 837 aa20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 KCNN3Q9UGI6 736 aa20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 KCND3Q9UK17 655 aa20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 TRAPPC4Q9Y296 219 aa20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa20.14■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa20.14■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 C10orf142B7Z368 130 aa20.14■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 B8ZZF3 427 aa20.14■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 TNFSF14O43557 240 aa20.14■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 CHRM4P08173 479 aa20.14■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 GGT2P36268 569 aa20.14■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 LSSP48449 732 aa20.14■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 IDH2P48735 452 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 CRISP3P54108 245 aa20.14■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 COMTD1Q86VU5 262 aa20.14■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 KRT73Q86Y46 540 aa20.14■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 FAM109AQ8N4B1 249 aa20.14■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 TM4SF19Q96DZ7 209 aa20.14■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 ZNF681Q96N22 645 aa20.14■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 POT1Q9NUX5 634 aa20.14■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 KCNE3Q9Y6H6 103 aa20.14■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 A8MV72 311 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 AP3D1O14617 1153 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 DNAJB6O75190 326 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 CPN2P22792 545 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 SOX6P35712 828 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 RPS5P46782 204 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 OR3A3P47888 321 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 OLR1P78380 273 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 GPLD1P80108 840 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 PRR5P85299 388 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 FZD2Q14332 565 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 TIGD6Q17RP2 521 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 CDONQ4KMG0 1287 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 GPAT3Q53EU6 434 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 TCTN3Q6NUS6 607 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 TBC1D24Q9ULP9 559 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 SPEF1Q9Y4P9 236 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 ZNF860A6NHJ4 632 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 M0R082 166 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 M0R3H8 397 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 EMC8O43402 210 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 IGLV3-19P01714 112 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 TNFRSF17Q02223 184 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 IDO2Q6ZQW0 420 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 NUP43Q8NFH3 380 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 KLHL6Q8WZ60 621 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 COL26A1Q96A83 441 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 PILRAQ9UKJ1 303 aa20.13■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 C2orf74A8MZ97 194 aa20.12■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 GASTP01350 101 aa20.12■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 IL7P13232 177 aa20.12■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 CTSEP14091 401 aa20.12■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 CBLP22681 906 aa20.12■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 HTR2BP41595 481 aa20.12■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 PPP1CAP62136 330 aa20.12■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
MESP1-201ENST00000300057 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms