RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533507.5

NDUFS3-211, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 1,769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-211ENST00000533507 PROSER1Q86XN7 944 aa24.58■■□□□ 1.53
NDUFS3-211ENST00000533507 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
NDUFS3-211ENST00000533507 C9orf40Q8IXQ3 194 aa24.58■■□□□ 1.53
NDUFS3-211ENST00000533507 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
NDUFS3-211ENST00000533507 TMEM19Q96HH6 336 aa24.58■■□□□ 1.53
NDUFS3-211ENST00000533507 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF160Q9HCG1 818 aa24.58■■□□□ 1.53
NDUFS3-211ENST00000533507 A4GALTQ9NPC4 353 aa24.58■■□□□ 1.53
NDUFS3-211ENST00000533507 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa24.58■■□□□ 1.53
NDUFS3-211ENST00000533507 SPTBN4Q9H254 2564 aa24.58■■□□□ 1.53
NDUFS3-211ENST00000533507 A8MVJ9 347 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 ACOT8O14734 319 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 TFPTP0C1Z6 253 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 CLCN2P51788 898 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 GPR143P51810 404 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 OLIG3Q7RTU3 272 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 RAB43Q86YS6 212 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 ANKFN1Q8N957 763 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 APCDD1LQ8NCL9 501 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 STACQ99469 402 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 FAM117AQ9C073 453 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 ACTR3BQ9P1U1 418 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 ANGPT4Q9Y264 503 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 PCGF2P35227 344 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 HPCAP84074 193 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 CCNJQ5T5M9 372 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 REEP3Q6NUK4 255 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 SPATA24Q86W54 205 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 VPS50Q96JG6 964 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 Q9N2J8 555 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 DUSP22Q9NRW4 184 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 P4HTMQ9NXG6 502 aa24.57■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 GXYLT2A0PJZ3 443 aa24.56■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa24.56■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 CDC14CA4D256 554 aa24.56■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 MASP2O00187 686 aa24.56■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 PEX12O00623 359 aa24.56■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 RNF4P78317 190 aa24.56■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 VEZF1Q14119 521 aa24.56■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 EBPQ15125 230 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 FIGNL1Q6PIW4 674 aa24.56■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 OR4N2Q8NGD1 307 aa24.56■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 NSMCE2Q96MF7 247 aa24.56■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 TRIM15Q9C019 465 aa24.56■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 MUC13Q9H3R2 512 aa24.56■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 GIN1Q9NXP7 522 aa24.56■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 FBXL4Q9UKA2 621 aa24.56■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 OR6C76A6NM76 312 aa24.55■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 NKX2-2O95096 273 aa24.55■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 CRISP3P54108 245 aa24.55■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 GNA13Q14344 377 aa24.55■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 EXT1Q16394 746 aa24.55■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 NPSR1Q6W5P4 371 aa24.55■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 EFHD1Q9BUP0 239 aa24.55■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 WWTR1Q9GZV5 400 aa24.55■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 LIPT1Q9Y234 373 aa24.55■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 MSRB2Q9Y3D2 182 aa24.55■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 H6PDO95479 791 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 CT45A8P0DMV1 189 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 CT45A9P0DMV2 189 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 ATP6V1B2P21281 511 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 CT45A2Q5DJT8 189 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 DCST2Q5T1A1 773 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 NACC2Q96BF6 587 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 SEMA4CQ9C0C4 833 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 WASF3Q9UPY6 502 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 V9GYQ6 96 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 CELA2AP08217 269 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 MAP3K8P41279 467 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 PPICP45877 212 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 POLE2P56282 527 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 FUT5Q11128 374 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 MRGPREQ86SM8 312 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 IMMP1LQ96LU5 166 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 BTBD2Q9BX70 525 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 DEFB126Q9BYW3 111 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa24.54■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 ENTPD5O75356 428 aa24.53■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 SOX30O94993 753 aa24.53■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 KDELR2P33947 212 aa24.53■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 ATP1A4Q13733 1029 aa24.53■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa24.53■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC30A8Q8IWU4 369 aa24.53■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC26A7Q8TE54 656 aa24.53■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 FGF11Q92914 225 aa24.53■■□□□ 1.52
NDUFS3-211ENST00000533507 ADIPOR1Q96A54 375 aa24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms