RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 ESM1Q9NQ30 184 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 RNF6Q9Y252 685 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS21Q9Y6M0 314 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC7Q96M83 1385 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 HCKP08631 526 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 PAX8Q06710 450 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 CCL14Q16627 93 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 CDKN3Q16667 212 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 Q7L0L9 218 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 RAB7BQ96AH8 199 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM15Q9C019 465 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM9Q9C026 710 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 GRIN2DO15399 1336 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 MCF2LO15068 1137 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 TYROBPO43914 113 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ASNSP08243 561 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 EPB41P11171 864 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 PRPHP41219 470 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 PRELPP51888 382 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 MFAP2P55001 183 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 HAND2P61296 217 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 MS4A2Q01362 244 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 PCK2Q16822 640 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ACER2Q5QJU3 275 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 SULT1C3Q6IMI6 304 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 CBLN3Q6UW01 205 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 NTNG2Q96CW9 530 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 TTYH2Q9BSA4 534 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 RDH8Q9NYR8 311 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf98E9PRG8 122 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 SDC3O75056 442 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 GSK3BP49841 420 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 EMDP50402 254 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF85Q03923 595 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF440Q8IYI8 595 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 WBP1Q96G27 269 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF599Q96NL3 588 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 RAI14Q9P0K7 980 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 MLXQ9UH92 298 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 B9D1Q9UPM9 204 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GTH9 108 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 E9PQ18 207 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 JAK2O60674 1132 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 MT-ND1P03886 318 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 CSF2P04141 144 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 SLC36A3Q495N2 470 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ARMCX2Q7L311 632 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ART4Q93070 314 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 TADA1Q96BN2 335 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 AMBNQ9NP70 447 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC30A6NM36 301 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 SDHDO14521 159 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 SEMA4FO95754 770 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 PSMA2P25787 234 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ETV5P41161 510 aa6.18□□□□□ -1.42
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