RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 PEX11GQ96HA9 241 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 CD180Q99467 661 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 IER2Q9BTL4 223 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 UCK2Q9BZX2 261 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 RAB33BQ9H082 229 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 NOL3O60936 208 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 IFI6P09912 130 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC5A2P31639 672 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 IFNA8P32881 189 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 SOX18P35713 384 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 STX4Q12846 297 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 COX18Q8N8Q8 333 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa22.37■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 DUSP21Q9H596 190 aa22.37■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 SH3PXD2BA1X283 911 aa22.36■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 TAS2R41P59536 307 aa22.36■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 SLC35A2P78381 396 aa22.36■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 TUBA3CQ13748 450 aa22.36■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa22.36■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 LINC00471Q8N535 108 aa22.36■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 OR6C4Q8NGE1 309 aa22.36■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 OR13F1Q8NGS4 319 aa22.36■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 ARHGDIGQ99819 225 aa22.36■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 CTPS2Q9NRF8 586 aa22.36■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 DUSP22Q9NRW4 184 aa22.36■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 ERVK-18Q9QC07 812 aa22.36■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 BLACEA4D250 179 aa22.35■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 MED26O95402 600 aa22.35■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 VWA5B2Q8N398 1253 aa22.35■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR151Q8TDV0 419 aa22.35■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 APH1BQ8WW43 257 aa22.35■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.35■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa22.35■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 PGBD2Q6P3X8 592 aa22.34■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 RHOXF1Q8NHV9 184 aa22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 CTHRC1Q96CG8 243 aa22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 FUZQ9BT04 418 aa22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 DGCR6LQ9BY27 220 aa22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 SATB2Q9UPW6 733 aa22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 AP3D1O14617 1153 aa22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 FRS3O43559 492 aa22.34■■□□□ 1.17
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