RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		15.22	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		15.22	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	RELN	P78509	3460 aa		15.22	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		15.22	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A087WV62	115 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	BCKDK	O14874	412 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	T	O15178	435 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDPK1	O15530	556 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	SUSD5	O60279	629 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	ABCB7	O75027	752 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAPPC6A	O75865	159 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHG3	P01860	377 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	SERPINE1	P05121	402 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	SDC1	P18827	310 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	GRK2	P25098	689 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	IL12B	P29460	328 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	MC3R	P41968	323 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	CASP3	P42574	277 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	HHAT	Q5VTY9	493 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM107	Q6UX40	140 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIL	Q7L0X0	811 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	PROK2	Q9HC23	129 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	FLNC	Q14315	2725 aa		15.21	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRSS44	E7EML9	344 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLOD2	O00469	737 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	HCN1	O60741	890 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	COL8A1	P27658	744 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	SOX18	P35713	384 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	HPCAL1	P37235	193 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSPB3	Q12988	150 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ART3	Q13508	389 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	GXYLT1	Q4G148	440 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	WLS	Q5T9L3	541 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMBIM1	Q969X1	311 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	MTERF3	Q96E29	417 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ELP4	Q96EB1	424 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	FCRL1	Q96LA6	429 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	COL21A1	Q96P44	957 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	BTBD9	Q96Q07	612 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1B0GVC2	190 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	AQP7	O14520	342 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	GNB5	O14775	395 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	UGT2B11	O75310	529 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	CELA3A	P09093	270 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	CT45A8	P0DMV1	189 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	CT45A9	P0DMV2	189 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRPS2	P11908	318 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	BCKDHA	P12694	445 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	AGA	P20933	346 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC1A6	P48664	564 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	CORO7	P57737	925 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	STX3	Q13277	289 aa		15.19	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	SNTA1	Q13424	505 aa		15.19	■□□□□ 0.02

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