RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 CHP2O43745 196 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF84P51523 738 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PGBD5Q8N414 524 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 OR9Q2Q8NGE9 314 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 HOXD1Q9GZZ0 328 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 MYH4Q9Y623 1939 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 GON4LQ3T8J9 2241 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PRLP01236 227 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 AKR1D1P51857 326 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PLP2Q04941 152 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CCINQ13939 588 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 IRF4Q15306 451 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ADGRG5Q8IZF4 528 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ACOT4Q8N9L9 421 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 DENND6BQ8NEG7 585 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 BEX2Q9BXY8 128 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 BEX1Q9HBH7 125 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CACNA1SQ13698 1873 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 GABRR3A8MPY1 467 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 DISC1C4P0D8 188 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 L7N2F9 121 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 VAMP2P63027 116 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PRSS48Q7RTY5 328 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 IL22RA1Q8N6P7 574 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC6A15Q9H2J7 730 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 MYNNQ9NPC7 610 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 EBF1Q9UH73 591 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 BTAF1O14981 1849 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CD8B2A6NJW9 211 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 C1SP09871 688 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CD8BP10966 210 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ZFP41Q8N8Y5 198 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 OR4K13Q8NH42 304 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 FKBP10Q96AY3 582 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 NELL2Q99435 816 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 HHATLQ9HCP6 504 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 STUB1Q9UNE7 303 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 VSTM2BA6NLU5 285 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 HIDE1A8MVS5 230 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 S100A6P06703 90 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 GRPRP30550 384 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PHC1P78364 1004 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CDKL1Q00532 357 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SPIN3Q5JUX0 258 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM69BQ5VUD6 431 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PLBD1Q6P4A8 553 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 LRFN4Q6PJG9 635 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 FCAMRQ8WWV6 532 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PHOX2BQ99453 314 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 MARCH5Q9NX47 278 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 RIMS3Q9UJD0 308 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CLEC4EQ9ULY5 219 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 DHDHQ9UQ10 334 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR52Q9Y2T5 361 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 C1orf105O95561 183 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 GSTT2P0CG29 244 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 GABRB3P28472 473 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 DPP6P42658 865 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 THAP6Q8TBB0 222 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 WDR20Q8TBZ3 569 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 GAL3ST3Q96A11 431 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 UBXN10Q96LJ8 280 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 VNN3Q9NY84 501 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PADI2Q9Y2J8 665 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ADH7P40394 386 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SERTAD2Q14140 314 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CARD17Q5XLA6 110 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 EPHA6Q9UF33 1036 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SH2B3Q9UQQ2 575 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CLCA1A8K7I4 914 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 GLP1RP43220 463 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 IQCF1Q8N6M8 205 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PREBQ9HCU5 417 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 IL20RAQ9UHF4 553 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 C4AP0C0L4 1744 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 HHLA1C9JL84 531 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 IFNA7P01567 189 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CMPK2Q5EBM0 449 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 RAET1LQ5VY80 246 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 NUDT15Q9NV35 164 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV6A0A075B6T7 132 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A0J9YY10 115 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 VSTM5A8MXK1 200 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CDKN2CP42773 168 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT8Q16880 541 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 TMPRSS12Q86WS5 348 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 FOXRED2Q8IWF2 684 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 HDHD5Q9BXW7 423 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM165Q9HC07 324 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms