RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.59■□□□□ 0.89
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USP4-208ENST00000464168 SMR3AQ99954 134 aa20.59■□□□□ 0.89
USP4-208ENST00000464168 YIPF4Q9BSR8 244 aa20.59■□□□□ 0.89
USP4-208ENST00000464168 NTMT1Q9BV86 223 aa20.59■□□□□ 0.89
USP4-208ENST00000464168 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
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USP4-208ENST00000464168 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
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USP4-208ENST00000464168 PLXDC2Q6UX71 529 aa20.57■□□□□ 0.88
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USP4-208ENST00000464168 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
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USP4-208ENST00000464168 UCN2Q96RP3 112 aa20.56■□□□□ 0.88
USP4-208ENST00000464168 RAB17Q9H0T7 212 aa20.56■□□□□ 0.88
USP4-208ENST00000464168 VPS11Q9H270 941 aa20.56■□□□□ 0.88
USP4-208ENST00000464168 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.56■□□□□ 0.88
USP4-208ENST00000464168 EHD3Q9NZN3 535 aa20.56■□□□□ 0.88
USP4-208ENST00000464168 KLRF1Q9NZS2 232 aa20.56■□□□□ 0.88
USP4-208ENST00000464168 PYCARDQ9ULZ3 195 aa20.56■□□□□ 0.88
USP4-208ENST00000464168 PLLPQ9Y342 182 aa20.56■□□□□ 0.88
USP4-208ENST00000464168 C1orf226A1L170 272 aa20.55■□□□□ 0.88
USP4-208ENST00000464168 H0Y3Z8 333 aa20.55■□□□□ 0.88
USP4-208ENST00000464168 GUCY1B2O75343 617 aa20.55■□□□□ 0.88
USP4-208ENST00000464168 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
USP4-208ENST00000464168 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
USP4-208ENST00000464168 DRD5P21918 477 aa20.55■□□□□ 0.88
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