RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 ING4Q9UNL4 249 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CYP8B1Q9UNU6 501 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 OR1A2Q9Y585 309 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ANKRD36A6QL64 1941 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 PCDH17O14917 1159 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 PRAMEF10O60809 474 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CLDN9O95484 217 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 GBAP04062 536 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SEMG1P04279 462 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 C8GP07360 202 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 C1SP09871 688 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 PRPS2P11908 318 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 GLULP15104 373 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 HPGDP15428 266 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 GABRB1P18505 474 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 AKT2P31751 481 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 OPRD1P41143 372 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CRATP43155 626 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CLCN7P51798 805 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 RPA4Q13156 261 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 GALEQ14376 348 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM31Q5JXX7 168 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 USP30Q70CQ3 517 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TRIM46Q7Z4K8 759 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 LRRTM4Q86VH4 590 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 HDHD2Q9H0R4 259 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 LMAN1LQ9HAT1 526 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 BRCA2P51587 3418 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 POLEQ07864 2286 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 OR5K3A6NET4 321 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM227AF5H4B4 570 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 H3BN98 237 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 LRRTM2O43300 516 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 IFNA16P05015 189 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 POU2F2P09086 479 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 P2RY2P41231 377 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 LRRC32Q14392 662 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ANGPT1Q15389 498 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 P2RY14Q15391 338 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 AMZ1Q400G9 498 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 C9orf64Q5T6V5 341 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CNIH2Q6PI25 160 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 PDZD3Q86UT5 571 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 LIX1LQ8IVB5 337 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 C9orf62Q8N4C0 152 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC25A46Q96AG3 418 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM80Q96HE8 168 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TPSD1Q9BZJ3 242 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CUL9Q8IWT3 2517 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 APOL3O95236 402 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 EGFP01133 1207 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 PER3P56645 1201 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 MICAQ29983 383 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 LEXMQ3ZCV2 418 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 KLHL12Q53G59 568 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM65Q6PI78 240 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SFTPA1Q8IWL2 248 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 LRRC17Q8N6Y2 441 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC17A9Q9BYT1 436 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC6A17Q9H1V8 727 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 KCNK6Q9Y257 313 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 HYKKA2RU49 373 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 FZD6O60353 706 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 TP53P04637 393 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 EBLN1P0CF75 366 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 SSTR2P30874 369 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 CLCNKAP51800 687 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 C19orf48Q6RUI8 117 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 TEX261Q6UWH6 196 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM129CQ86XR2 697 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 KIF18BQ86Y91 864 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC44A3Q8N4M1 653 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 KLHL6Q8WZ60 621 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 RIT1Q92963 219 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 MED28Q9H204 178 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 CLEC1BQ9P126 229 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 U3KQ87 197 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 AKAP6Q13023 2319 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 CISD3P0C7P0 127 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 GPX2P18283 190 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 MAPK1P28482 360 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 ACTR1BP42025 376 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 TNFRSF4P43489 277 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 ACTR1AP61163 376 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 FCN2Q15485 313 aa10.58□□□□□ -0.72
RPRD1B-201ENST00000373433 STK11Q15831 433 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms