RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344376.9

ATG4B-201, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-201ENST00000344376 EXO5Q9H790 373 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-201ENST00000344376 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-201ENST00000344376 C1orf109Q9NX04 203 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-201ENST00000344376 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-201ENST00000344376 RAB21Q9UL25 225 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-201ENST00000344376 DTX4Q9Y2E6 619 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-201ENST00000344376 BCKDKO14874 412 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ATP8B1O43520 1251 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 PPM1BO75688 479 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SLITRK5O94991 958 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 LRATO95237 230 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 PRPH2P23942 346 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SERPINB5P36952 375 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 MASP1P48740 699 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 MAN2A2P49641 1150 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF787Q6DD87 383 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TMEM211Q6ICI0 200 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TRILQ7L0X0 811 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 PACS2Q86VP3 889 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 MAST4O15021 2626 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 FRG2CA6NGY1 282 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 NPIPA2E9PIF3 369 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 NPIPB8E9PQR5 432 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 NPIPA3F8WFD2 350 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SUSD5O60279 629 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 HCN1O60741 890 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SNX4O95219 450 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 DRD5P21918 477 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 PPICP45877 212 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 EMDP50402 254 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 PSPHP78330 225 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 DUSP8Q13202 625 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 CEBPEQ15744 281 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 KANK2Q63ZY3 851 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 DDIASQ8IXT1 998 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 LIX1Q8N485 282 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 KAT2AQ92830 837 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SARAFQ96BY9 339 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 OMA1Q96E52 524 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 RILPQ96NA2 401 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 DMRTA2Q96SC8 542 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 MECRQ9BV79 373 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 METTL7AQ9H8H3 244 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 CHST11Q9NPF2 352 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 LIPGQ9Y5X9 500 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 A0A1B0GVC2 190 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 FIGNL2A6NMB9 653 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 AQP7O14520 342 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 COQ9O75208 318 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 GDF1P27539 372 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 NUP54Q7Z3B4 507 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 CLYBLQ8N0X4 340 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 CCT7Q99832 543 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 PROK2Q9HC23 129 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TAS2R9Q9NYW1 312 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ADAM10O14672 748 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 PLOD3O60568 738 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 CLDN14O95500 239 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 CHRNGP07510 517 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 FGF4P08620 206 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 CELA3AP09093 270 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 LINC00032P0C843 101 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 HTR1EP28566 365 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SOX18P35713 384 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 KRT20P35900 424 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF844Q08AG5 666 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SH2D4BQ5SQS7 431 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 MYO7BQ6PIF6 2116 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 BTBD9Q96Q07 612 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 RUBCNLQ9H714 662 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ACAD8Q9UKU7 415 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms