RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PGBD2Q6P3X8 592 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUP43Q8NFH3 380 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TM4SF19Q96DZ7 209 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLEKHA8Q96JA3 519 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C10orf90Q96M02 699 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR7D2Q96RA2 312 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C3orf14Q9HBI5 128 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MS4A12Q9NXJ0 267 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PRQ8 180 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGEB3O15480 346 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 P2RX6O15547 441 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LGI1O95970 557 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STSP08842 583 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UGT2B15P54855 530 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ST3GAL4Q11206 333 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ILKQ13418 452 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q6ZSR6 202 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTCHD4Q6ZW05 846 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR6T1Q8NGN1 323 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR10G6Q8NH81 332 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL6Q8WZ60 621 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EQTNQ9NQ60 294 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MMP17Q9ULZ9 603 aa17.6■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EYSQ5T1H1 3165 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSAPA4D1B5 854 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLDN24A6NM45 220 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 M0R3G1 203 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CASC3O15234 703 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOX14O95416 240 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEMA4FO95754 770 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIPAP38571 399 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAN2A2P49641 1150 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NCS1P62166 190 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNFRSF17Q02223 184 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LTB4RQ15722 352 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FCRL6Q6DN72 434 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STX19Q8N4C7 294 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC15A4Q8N697 577 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM46DQ8NEK8 389 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 B3GNT7Q8NFL0 401 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HMGB4Q8WW32 186 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KAT2AQ92830 837 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC38A4Q969I6 547 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PALMDQ9NP74 551 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C11orf16Q9NQ32 467 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAIMQ9NVQ4 179 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBCCD1Q9NVR7 557 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACTR10Q9NZ32 417 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH3D21A4FU49 640 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR6C74A6NCV1 312 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 M0R082 166 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASNA1O43681 348 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMIM10L1P0DMW3 83 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP17.59■□□□□ 0.411e-7■■■■□ 26.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCINQ13939 588 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYT16Q17RD7 645 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLCO6A1Q86UG4 719 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM48Q8IWZ4 208 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC44A3Q8N4M1 653 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR13H1Q8NG92 308 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP1R14BQ96C90 147 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMIM10Q96HG1 83 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FNDC11Q9BVV2 318 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PINK1Q9BXM7 581 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ROGDIQ9GZN7 287 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCMF1Q9P0J7 381 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDOR1Q9UHB4 597 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa17.59■□□□□ 0.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C2CD4DB7Z1M9 353 aa17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C10orf142B7Z368 130 aa17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLITRK5O94991 958 aa17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADORA3P0DMS8 318 aa17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OCA2Q04671 838 aa17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIGD6Q17RP2 521 aa17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DEFB134Q4QY38 66 aa17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PODNL1Q6PEZ8 512 aa17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FIGLAQ6QHK4 219 aa17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PATE1Q8WXA2 126 aa17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GIMAP5Q96F15 307 aa17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRRC1Q96M27 445 aa17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERINC2Q96SA4 455 aa17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC38A1Q9H2H9 487 aa17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms