RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF750Q32MQ0 723 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 C3orf36Q3SXR2 165 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 P2RY8Q86VZ1 359 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 DENND6AQ8IWF6 608 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CENPKQ9BS16 269 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 G6PC3Q9BUM1 346 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 OSBPL11Q9BXB4 747 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 RHOJQ9H4E5 214 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 WASHC1A8K0Z3 465 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 H7C1Q1 480 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 TAPBPO15533 448 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CELA3AP09093 270 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 RFPL3SP0C7P2 107 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 HSD3B1P14060 373 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 HSD3B2P26439 372 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 GP5P40197 560 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 NAA20P61599 178 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 MED27Q6P2C8 311 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 MICALCLQ6ZW33 695 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 GPR180Q86V85 440 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CYP4X1Q8N118 509 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 OR5M9Q8NGP3 310 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 OR1J4Q8NGS1 313 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 ATG4AQ8WYN0 398 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 UBXN10Q96LJ8 280 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 SERPINI1Q99574 410 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 TUBA1CQ9BQE3 449 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CD244Q9BZW8 370 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 PIF1Q9H611 641 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CXorf21Q9HAI6 301 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1W2PPR1 153 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 C16orf97H3BN30 126 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 GDF1P27539 372 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 MGAT5Q09328 741 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 TMCO6Q96DC7 493 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CSF3RQ99062 836 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 BRF2Q9HAW0 419 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 GIN1Q9NXP7 522 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 SIAH2O43255 324 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 TSPAN2O60636 221 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 ETS1P14921 441 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 EPORP19235 508 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CPN2P22792 545 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 BSGP35613 385 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 MGAT2Q10469 447 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 PDK3Q15120 406 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 PHC2Q8IXK0 858 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 NRGNQ92686 78 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CIDEBQ9UHD4 219 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 DOCK7Q96N67 2140 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF860A6NHJ4 632 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 NDUFS8O00217 210 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 WWP2O00308 870 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 CDC7O00311 574 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 GPR85P60893 370 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 IFT88Q13099 833 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-210ENST00000503258 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms