RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568290.1

ATXN3-250, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-250ENST00000568290 PSD4Q8NDX1 1056 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 OR4K1Q8NGD4 311 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 OR52J3Q8NH60 311 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 OR5K2Q8NHB8 316 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 SUSD6Q92537 303 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 PRRC1Q96M27 445 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 OR4K3Q96R72 315 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 MS4A8Q9BY19 250 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 HDAC8Q9BY41 377 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 OR2AG1Q9H205 316 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 MVB12BQ9H7P6 319 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 SLC25A19Q9HC21 320 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 OBP2AQ9NY56 170 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 NLGN3Q9NZ94 848 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 DEC1Q9P2X7 70 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 INSL6Q9Y581 213 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 DSPPQ9NZW4 1301 aa7.25□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 A0A0U1RQS6 177 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 AP3D1O14617 1153 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 RGS13O14921 159 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 NDUFS4O43181 175 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 PRAMEF4O60810 478 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 ADAM23O75077 832 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 MTX2O75431 263 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 ITGA10O75578 1167 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 MFN2O95140 757 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 PTHP01270 115 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 GASTP01350 101 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 BCHEP06276 602 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 YES1P07947 543 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 FHP07954 510 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 ACP2P11117 423 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 ERGP11308 486 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 CPEP16870 476 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 ACADLP28330 430 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 CA5AP35218 305 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 HOXD12P35452 270 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 AHRP35869 848 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 TALDO1P37837 337 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 STAT5AP42229 794 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 PREPP48147 710 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 CTSCP53634 463 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 MLLT10P55197 1068 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 TAS2R43P59537 309 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 ASAH1Q13510 395 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 TRAM2Q15035 370 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 PDGFRLQ15198 375 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 QPRTQ15274 297 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 SEC23BQ15437 767 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 TRIM60Q495X7 471 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 PLK5Q496M5 336 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 ZFP69Q49AA0 526 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 MINDY4Q4G0A6 757 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 LCN1P1Q5VSP4 162 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 TRIQKQ629K1 86 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 SLC27A4Q6P1M0 643 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 DEF8Q6ZN54 512 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 FAM129CQ86XR2 697 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 GID4Q8IVV7 300 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 PEX5LQ8IYB4 626 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 CDK20Q8IZL9 346 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 SIMC1Q8NDZ2 872 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 PIGXQ8TBF5 258 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 ENKURQ8TC29 256 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 SGCDQ92629 289 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 HTRA1Q92743 480 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 MAL2Q969L2 176 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 SLC22A18Q96BI1 424 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 TMEM19Q96HH6 336 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 CAPNS2Q96L46 248 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 CNPPD1Q9BV87 410 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 TAPBPLQ9BX59 468 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 TSSK6Q9BXA6 273 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 OR51B5Q9H339 312 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 FBRSQ9HAH7 460 aa7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ATXN3-250ENST00000568290 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms