RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 MED7O43513 233 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 PIP5K1CO60331 668 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 STX11O75558 287 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 RP2O75695 350 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCGB1D2O95969 90 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEMG1P04279 462 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 HCKP08631 526 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR8U8P0C7N1 319 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 MTHFD2P13995 350 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 NFYBP25208 207 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 HTR5AP47898 357 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDKN2DP55273 166 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 CAP1Q01518 475 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNAB1Q14722 419 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 CALHM3Q86XJ0 350 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 NAGSQ8N159 534 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF383Q8NA42 475 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRR1Q96L50 414 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 HBEGFQ99075 208 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 FEVQ99581 238 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 NLNQ9BYT8 704 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 CA10Q9NS85 328 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 C1orf109Q9NX04 203 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 DUSP12Q9UNI6 340 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 COLCA2A8K830 154 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 FZD7O75084 574 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC34A2O95436 690 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 TFP02787 698 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 FABP3P05413 133 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 ITGA3P26006 1051 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 S100A11P31949 105 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 RGS4P49798 205 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPT1P50897 306 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLDN8P56748 225 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 STARD6P59095 220 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB8AP61006 207 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB5BP61020 215 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 POU4F2Q12837 409 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAP4K2Q12851 820 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR4D1Q15615 310 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 ERFEQ4G0M1 354 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 Q6ZSR9 355 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMUB2Q71RG4 321 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 REC114Q7Z4M0 266 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 STYXL1Q9Y6J8 313 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 I3L1I5 382 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 J3KR12 359 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 FPGTO14772 594 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPM1DO15297 605 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 OIP5O43482 229 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR37L1O60883 481 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 SOX30O94993 753 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 SERPINA3P01011 423 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 ELK1P19419 428 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 NFKB1P19838 968 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 C4BPBP20851 252 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 GNG10P50151 68 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 CASP9P55211 416 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 TGFB2P61812 414 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 MISPQ8IVT2 679 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 CMIPQ8IY22 773 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 SVBPQ8N300 66 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHFRQ96EP1 664 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 ASB16Q96NS5 453 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D3-210ENST00000490478 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.55□□□□□ -1.36
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