RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394744.6

RAB11FIP4-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAB11FIP4, Length 1,968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GSSP48637 474 aa18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NUP107P57740 925 aa18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CXCR4P61073 352 aa18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FZD2Q14332 565 aa18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CEBPEQ15744 281 aa18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 OR9A2Q8NGT5 310 aa18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZFPM2Q8WW38 1151 aa18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 COG8Q96MW5 612 aa18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF681Q96N22 645 aa18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DOK1Q99704 481 aa18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCDC90BQ9GZT6 254 aa18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 EVA1BQ9NVM1 165 aa18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KCND3Q9UK17 655 aa18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PILRAQ9UKJ1 303 aa18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 POFUT2Q9Y2G5 429 aa18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCNB2O95067 398 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SRFP11831 508 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PVRP15151 417 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PPP2R1BP30154 601 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MPIP34949 423 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LSSP48449 732 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FRMPD2BQ6IN97 320 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 BHLHB9Q6PI77 547 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TAF8Q7Z7C8 310 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ENTHD1Q8IYW4 607 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 OR4N4Q8N0Y3 316 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 OR56A1Q8NGH5 318 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 OR4D11Q8NGI4 311 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC37A2Q8TED4 501 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 C16orf58Q96GQ5 468 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF354BQ96LW1 612 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ALPK1Q96QP1 1244 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 WFDC6Q9BQY6 131 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ANKMY1Q9P2S6 941 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TPRKBQ9Y3C4 175 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 A8MVJ9 347 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PCDHGA12O60330 932 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 WBP4O75554 376 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SERPINB7O75635 380 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ATE1O95260 518 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FHP07954 510 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SMIM10L1P0DMW3 83 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MC3RP41968 323 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FUT5Q11128 374 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 C1orf61Q13536 156 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DEFB134Q4QY38 66 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SYT13Q7L8C5 426 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 APH1BQ8WW43 257 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RLN3Q8WXF3 142 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KLHL6Q8WZ60 621 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MOAP1Q96BY2 351 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SMIM10Q96HG1 83 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 C10orf90Q96M02 699 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RHNO1Q9BSD3 238 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DUSP21Q9H596 190 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ANKRA2Q9H9E1 313 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SCN3BQ9NY72 215 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ERVK-18Q9QC07 812 aa18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 C2orf74A8MZ97 194 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 EMC8O43402 210 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NDUFS2O75306 463 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SEMA7AO75326 666 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 POU2F1P14859 743 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PCMT1P22061 227 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CD6P30203 668 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KRT20P35900 424 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GGT2P36268 569 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CRISP3P54108 245 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC35A2P78381 396 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TNFRSF17Q02223 184 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TUBA3CQ13748 450 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LTB4RQ15722 352 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TCTN3Q6NUS6 607 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TAGAPQ8N103 731 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RASSF5Q8WWW0 418 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MUL1Q969V5 352 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PSD2Q9BQI7 771 aa18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GPR27Q9NS67 375 aa18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms