RNA–Protein interactions for RNA: YLR143W

DPH6, Transcript of Diphthamide synthetase, yeast

Gene DPH6, Length 2,058 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DPH6	YLR143W	GCV2	P49095	1034 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	ALT2	P52892	507 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	YNR014W	P53719	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	ROD1	Q02805	837 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	MUK1	Q02866	612 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	COQ9	Q05779	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	WHI2	P12611	486 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	ALG1	P16661	449 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	CKA2	P19454	339 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	VPS35	P34110	944 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	MRPL7	P36519	292 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	SLX1	P38324	304 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	YHR131C	P38835	850 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	OPT1	P40897	799 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	ELG1	Q12050	791 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	PCD1	Q12524	340 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DPH6	YLR143W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	DPH2	P32461	534 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	FMP10	P40098	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	CTF18	P49956	741 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	DIP5	P53388	608 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	ESL1	P40456	1118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	BRE2	P43132	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	DCS2	Q12123	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	OSW2	Q12202	724 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	RLF2	Q12495	606 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	RPC31	P17890	251 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	RAM2	P29703	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	COT1	P32798	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	LEO1	P38439	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	YHL026C	P38740	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	NUP82	P40368	713 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	YGR153W	P48238	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	ISM1	P48526	1002 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	PGA2	P53903	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	YNL034W	P53963	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	YNL018C	P53976	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	DAP1	Q12091	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	MOT1	P32333	1867 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	URK1	P27515	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	TMT1	P32643	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	RFC5	P38251	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	STB5	P38699	743 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	LAM5	P43560	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	CBK1	P53894	756 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	SDH5	Q08230	162 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	MPC54	Q08550	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	FOB1	O13329	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	RAS1	P01119	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	RPC53	P25441	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	BIO2	P32451	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	UBX7	P38349	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	SHE10	P53075	577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	PEX14	P53112	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	YGR130C	P53278	816 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	SEC5	P89102	971 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	CUR1	Q06469	252 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	MRX3	P38172	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	SIP3	P38717	1229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	YHR202W	P38887	602 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	THI6	P41835	540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	DAK2	P43550	591 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	SAD1	P43589	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	INP52	P50942	1183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	RTT102	P53330	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
DPH6	YLR143W	ECM7	Q06200	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	IES4	Q08561	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	COQ8	P27697	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	ENT3	P47160	408 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	CUL3	P53202	744 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPH6	YLR143W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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