RNA–Protein interactions for RNA: YKR068C

BET3, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene BET3, Length 582 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BET3	YKR068C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	SLA2	P33338	968 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	MNR2	P35724	969 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	GEM1	P39722	662 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	CHA4	P43634	648 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	OMS1	Q06668	471 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	XYL2	Q07993	356 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	IRC10	Q08118	586 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	ENB1	Q08299	606 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	MCM2	P29469	868 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	RER2	P35196	286 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	YER158C	P40095	573 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	UFD4	P33202	1483 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	PET112	P33893	541 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	FYV10	P40492	516 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	SPR28	Q04921	423 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	OSW2	Q12202	724 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	RPO31	P04051	1460 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	IRC20	Q06554	1556 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	SUL1	P38359	859 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	YGR012W	P53206	393 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	ACF2	Q12168	779 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	CHD1	P32657	1468 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BET3	YKR068C	KTR4	P38131	464 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	YAP1801	P38856	637 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	PNT1	P38969	423 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	NPC2	Q12408	173 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	SPE1	P08432	466 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	CDC34	P14682	295 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	LYP1	P32487	611 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	SRP101	P32916	621 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	CCC2	P38995	1004 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	STB4	P50104	949 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	SVF1	Q05515	481 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	RKR1	Q04781	1562 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	SPO20	Q04359	397 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	RKM4	Q12504	494 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	DRS2	P39524	1355 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	CLN2	P20438	545 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	SCT1	P32784	759 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	MET10	P39692	1035 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	MTC3	P53077	123 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	CDA1	Q06702	301 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	AFT2	Q08957	416 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	TYW3	P53177	273 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	LAS17	Q12446	633 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	HOF1	Q05080	669 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	HSF1	P10961	833 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	KAR4	P25583	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
BET3	YKR068C	YKL107W	P34251	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	MTH1	P35198	433 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	NCS6	P53088	359 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
BET3	YKR068C	MDM38	Q08179	573 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	GUP2	Q08929	609 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	PAN1	P32521	1480 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BET3	YKR068C	INO1	P11986	533 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	SIN3	P22579	1536 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	DUT1	P33317	147 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	ATG19	P35193	415 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	ICT1	Q12385	394 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	YPK9	Q12697	1472 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	ERG4	P25340	473 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	YGL176C	P46945	554 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	BUL1	P48524	976 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	YGR053C	P53234	283 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	RNT1	Q02555	471 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	EEB1	Q02891	456 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	SRT1	Q03175	343 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	YAP7	Q08182	245 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	SCC2	Q04002	1493 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	FUN30	P31380	1131 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	SPC42	P36094	363 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	MAD1	P40957	749 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	DNF2	Q12675	1612 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	YKL151C	P36059	337 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	GIC1	P38785	314 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	GND2	P53319	492 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BET3	YKR068C	ESP1	Q03018	1630 aa		4.05	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.2 ms