RNA–Protein interactions for RNA: YKL036C

YKL036C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL036C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL036CYKL036C BIK1P11709 440 aa20.33■□□□□ 0.85
YKL036CYKL036C YAP1801P38856 637 aa20.33■□□□□ 0.85
YKL036CYKL036C HEH2Q03281 663 aa20.33■□□□□ 0.85
YKL036CYKL036C YLR455WQ06188 304 aa20.33■□□□□ 0.85
YKL036CYKL036C IES4Q08561 116 aa20.33■□□□□ 0.85
YKL036CYKL036C FOB1O13329 566 aa20.32■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C HIS4P00815 799 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C DPH2P32461 534 aa20.32■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C UBX7P38349 436 aa20.32■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C GUP1P53154 560 aa20.32■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C RPC53P25441 422 aa20.31■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C YHL026CP38740 315 aa20.31■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C VPS35P34110 944 aa20.3■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C APN2P38207 520 aa20.3■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C ERC1P38767 581 aa20.3■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C BUD16P39988 312 aa20.3■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C ESL1P40456 1118 aa20.3■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C LAM5P43560 674 aa20.3■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C YNL146WP53906 100 aa20.3■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C ARK1P53974 638 aa20.3■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C DOT1Q04089 582 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C ISY1P21374 235 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C PGM2P37012 569 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C YHR131CP38835 850 aa20.29■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C POL3P15436 1097 aa20.28■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C URK1P27515 501 aa20.27■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C YGL081WP53156 320 aa20.27■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C COG8Q04632 607 aa20.27■□□□□ 0.84
YKL036CYKL036C INP52P50942 1183 aa20.26■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C SEC5P89102 971 aa20.26■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C MRPL7P36519 292 aa20.25■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C CUE3P53137 624 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C MNP1P53163 194 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C CUL3P53202 744 aa20.25■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C PNG1Q02890 363 aa20.25■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C YDR090CQ03193 310 aa20.25■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C PRC1P00729 532 aa20.24■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C GLN3P18494 730 aa20.24■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C SKG6P32900 734 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C VTC2P43585 828 aa20.24■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C TOF1P53840 1238 aa20.24■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C ADE4P04046 510 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C YSC83P32792 385 aa20.23■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C UBP13P38187 747 aa20.23■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C VID24P38263 362 aa20.23■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C ECM7Q06200 448 aa20.23■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C CUR1Q06469 252 aa20.23■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C ADK2P26364 225 aa20.22■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C BMH1P29311 267 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C PPS1P38148 807 aa20.22■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C MRX3P38172 270 aa20.22■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C YNL034WP53963 612 aa20.22■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C YNL018CP53976 612 aa20.22■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C SPO71Q03868 1245 aa20.22■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C HRQ1Q05549 1077 aa20.22■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C NAM7P30771 971 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C CSE2P33308 149 aa20.21■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C PSR2Q07949 397 aa20.21■□□□□ 0.83
YKL036CYKL036C PCK1P10963 549 aa20.2■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data20.2■□□□□ 0.82not detected
YKL036CYKL036C TAM41P53230 385 aa20.2■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C PCT1P13259 424 aa20.19■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C SYN8P31377 255 aa20.19■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C FAF1P40546 346 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C ISM1P48526 1002 aa20.19■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C VTC3Q02725 835 aa20.19■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C YDL057WQ07379 328 aa20.19■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C YOR022CQ12204 715 aa20.19■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C RPT1P33299 467 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C RFT1P38206 574 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C SHE10P53075 577 aa20.18■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C ENV11P53246 860 aa20.18■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C COX4P04037 155 aa20.17■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C TOM70P07213 617 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C MBR1P23493 339 aa20.17■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C OYE3P41816 400 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C YPL277CQ08989 487 aa20.17■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C ZPS1Q12512 249 aa20.17■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C MNN4P36044 1178 aa20.16■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C STB5P38699 743 aa20.16■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C YHR202WP38887 602 aa20.16■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C YFL052WP43551 465 aa20.16■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C YFL034WP43564 1073 aa20.16■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C TRS130Q03660 1102 aa20.16■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C RSA4P25382 515 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C HIR1P32479 840 aa20.15■□□□□ 0.82
YKL036CYKL036C CDC15P27636 974 aa20.14■□□□□ 0.81
YKL036CYKL036C RFS1P38234 210 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
YKL036CYKL036C DAP1Q12091 152 aa20.14■□□□□ 0.81
YKL036CYKL036C SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data20.13■□□□□ 0.81not detected
YKL036CYKL036C SEC21P32074 935 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
YKL036CYKL036C SNF7P39929 240 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
YKL036CYKL036C MMF1P40185 145 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
YKL036CYKL036C PEX19Q07418 342 aa20.13■□□□□ 0.81
YKL036CYKL036C YLR422WQ06409 1932 aa20.13■□□□□ 0.81
YKL036CYKL036C XDJ1P39102 459 aa20.12■□□□□ 0.81
YKL036CYKL036C SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data20.12■□□□□ 0.81not detected
YKL036CYKL036C PHO8P11491 566 aa20.11■□□□□ 0.81
YKL036CYKL036C BIO2P32451 375 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 72.7 ms