RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W OAR1P35731 278 aa4.66□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W MOH1P38191 138 aa4.66□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W PNT1P38969 423 aa4.66□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W FAA4P47912 694 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
SNX4YJL036W HIS5P07172 385 aa4.65□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W ZRG8P40021 1076 aa4.65□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W TIM54P47045 478 aa4.65□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W EXG2P52911 562 aa4.65□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W POB3Q04636 552 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W RAD4P14736 754 aa4.64□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W HRR25P29295 494 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W BUD6P41697 788 aa4.64□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W CHA4P43634 648 aa4.64□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W HUL5P53119 910 aa4.64□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W NAN1Q02931 896 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W MET6P05694 767 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W ENA1P13587 1091 aa4.63□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W PFK1P16861 987 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W TSR4P25040 408 aa4.63□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W ENA2Q01896 1091 aa4.63□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W OPI10Q08202 246 aa4.63□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W AIM39Q08223 395 aa4.63□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W OSW2Q12202 724 aa4.63□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W ENA5Q12691 1091 aa4.63□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W LYP1P32487 611 aa4.62□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W MTC3P53077 123 aa4.62□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W YAP1801P38856 637 aa4.61□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W NUP82P40368 713 aa4.61□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W YGR053CP53234 283 aa4.61□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W XYL2Q07993 356 aa4.61□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W KCS1Q12494 1050 aa4.61□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W RKM4Q12504 494 aa4.61□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W YGR161W-CQ3E744 92 aa4.61□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W TRP2P00899 507 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W TIM23P32897 222 aa4.6□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W DUT1P33317 147 aa4.6□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W YKL069WP36088 180 aa4.6□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W MNN1P39106 762 aa4.6□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W UBA2P52488 636 aa4.6□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W YGR012WP53206 393 aa4.6□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W YLL058WQ12198 575 aa4.6□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W PHO8P11491 566 aa4.59□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W YJR008WP47085 338 aa4.59□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W TYW3P53177 273 aa4.59□□□□□ -1.67
SNX4YJL036W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data4.59□□□□□ -1.67not detected
SNX4YJL036W INO1P11986 533 aa4.58□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W SNF7P39929 240 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W YLR125WQ12138 136 aa4.58□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W YKL107WP34251 309 aa4.57□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W TOM20P35180 183 aa4.57□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W ATG19P35193 415 aa4.57□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W KRI1P42846 591 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W YJR142WP47173 342 aa4.57□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W PSP2P50109 593 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W YGR125WP53273 1036 aa4.57□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W CDA1Q06702 301 aa4.57□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W SPO75Q07798 868 aa4.57□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W MDM38Q08179 573 aa4.57□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W ENB1Q08299 606 aa4.57□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W YPL066WQ12194 479 aa4.57□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W LAS17Q12446 633 aa4.57□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W OSH2Q12451 1283 aa4.57□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W TOP1P04786 769 aa4.56□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W SPE1P08432 466 aa4.56□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W HSF1P10961 833 aa4.56□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W GAL11P19659 1081 aa4.56□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W THI4P32318 326 aa4.56□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W MOT2P34909 587 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W YHR020WP38708 688 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W CCC2P38995 1004 aa4.56□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W YGL176CP46945 554 aa4.56□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W RTS3P53289 263 aa4.56□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W EEB1Q02891 456 aa4.56□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W SPO20Q04359 397 aa4.56□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W FLC1Q08967 793 aa4.56□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W SSB1P11484 613 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W FUN30P31380 1131 aa4.55□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W YKL151CP36059 337 aa4.55□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W YBR184WP38299 523 aa4.55□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W SSB2P40150 613 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W YGL081WP53156 320 aa4.55□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data4.55□□□□□ -1.68not detected
SNX4YJL036W SRT1Q03175 343 aa4.55□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W EFT1P32324 842 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W SRP101P32916 621 aa4.54□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W RSP5P39940 809 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W URM1P40554 99 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W BUL1P48524 976 aa4.54□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W NCS6P53088 359 aa4.54□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W HRQ1Q05549 1077 aa4.54□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W UBX5Q06682 500 aa4.54□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W YLR040CQ07988 224 aa4.54□□□□□ -1.68
SNX4YJL036W GUP2Q08929 609 aa4.54□□□□□ -1.68
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