RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	KIFC2	Q96AC6	838 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	IGFBP4	P22692	258 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	SCNN1A	P37088	669 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	OCLN	Q16625	522 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	LCE2C	Q5TA81	110 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	NBPF15	Q8N660	670 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM47	Q96LD4	638 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	MAN1A2	O60476	641 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP2B4	P23634	1241 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	POU4F2	Q12837	409 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	CABP1	Q9NZU7	370 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	SOBP	A7XYQ1	873 aa		7.22	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	TEAD4	Q15561	434 aa		7.22	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	7.22	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	C4orf17	Q53FE4	359 aa		7.22	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		7.22	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		7.22	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	RHOQ	P17081	205 aa		7.21	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		7.21	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		7.21	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		7.21	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	CFTR	P13569	1480 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	NOS2	P35228	1153 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	PHKA2	P46019	1235 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR44	Q5JSH3	913 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	SERTM1	A2A2V5	107 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXO3	O43524	673 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	PLA2G4A	P47712	749 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	POTEA	Q6S8J7	498 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD62	A6NC57	917 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	EML1	O00423	815 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		7.18	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		7.18	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		7.18	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	DPH6	Q7L8W6	267 aa		7.17	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	TXLNA	P40222	546 aa		7.16	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	PTS	Q03393	145 aa		7.16	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		7.16	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	AIDA	Q96BJ3	306 aa		7.16	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		7.16	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		7.16	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		7.16	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC35F4	A4IF30	521 aa		7.16	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		7.16	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		7.16	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	COL26A1	Q96A83	441 aa		7.16	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		7.16	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		7.15	□□□□□ -1.26
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GTH6	734 aa		7.15	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		7.15	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	BACH2	Q9BYV9	841 aa		7.15	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	7.15	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		7.15	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	MSX1	P28360	303 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	NGLY1	Q96IV0	654 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	ASB16	Q96NS5	453 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616		H3BRB1	525 aa		7.13	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		7.13	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms