RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 TTLL6Q8N841 843 aa37.95■■■■□ 3.67
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP37.95■■■■□ 3.67
SEMA3B-215ENST00000621029 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP37.95■■■■□ 3.67
SEMA3B-215ENST00000621029 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
SEMA3B-215ENST00000621029 TRIM35Q9UPQ4 493 aa37.94■■■■□ 3.66
SEMA3B-215ENST00000621029 KIF6Q6ZMV9 814 aa37.93■■■■□ 3.66
SEMA3B-215ENST00000621029 BCORQ6W2J9 1755 aa37.93■■■■□ 3.66
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM177BA6PVY3 158 aa37.92■■■■□ 3.66
SEMA3B-215ENST00000621029 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa37.92■■■■□ 3.66
SEMA3B-215ENST00000621029 HLFQ16534 295 aa37.91■■■■□ 3.66
SEMA3B-215ENST00000621029 RGL2O15211 777 aa37.89■■■■□ 3.66
SEMA3B-215ENST00000621029 C1QTNF8P60827 252 aa37.89■■■■□ 3.66
SEMA3B-215ENST00000621029 C9orf131Q5VYM1 1079 aa37.89■■■■□ 3.66
SEMA3B-215ENST00000621029 TPTE2Q6XPS3 522 aa37.88■■■■□ 3.65
SEMA3B-215ENST00000621029 TTLL7Q6ZT98 887 aa37.88■■■■□ 3.65
SEMA3B-215ENST00000621029 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa37.88■■■■□ 3.65
SEMA3B-215ENST00000621029 ERBB4Q15303 1308 aa37.87■■■■□ 3.65
SEMA3B-215ENST00000621029 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa37.87■■■■□ 3.65
SEMA3B-215ENST00000621029 CHL1O00533 1208 aa37.86■■■■□ 3.65
SEMA3B-215ENST00000621029 APAF1O14727 1248 aa37.86■■■■□ 3.65
SEMA3B-215ENST00000621029 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
SEMA3B-215ENST00000621029 NECTIN2Q92692 538 aa37.86■■■■□ 3.65
SEMA3B-215ENST00000621029 ZBTB3Q9H5J0 574 aa37.86■■■■□ 3.65
SEMA3B-215ENST00000621029 ERVV-1B6SEH8 477 aa37.85■■■■□ 3.65
SEMA3B-215ENST00000621029 RNF181Q9P0P0 153 aa37.84■■■■□ 3.65
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
SEMA3B-215ENST00000621029 ANP32CO43423 234 aa37.81■■■■□ 3.64
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa37.8■■■■□ 3.64
SEMA3B-215ENST00000621029 RASSF7Q02833 373 aa37.8■■■■□ 3.64
SEMA3B-215ENST00000621029 KRT24Q2M2I5 525 aa37.8■■■■□ 3.64
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC184Q52MB2 194 aa37.8■■■■□ 3.64
SEMA3B-215ENST00000621029 DLEC1Q9Y238 1755 aa37.79■■■■□ 3.64
SEMA3B-215ENST00000621029 ANXA1P04083 346 aa37.79■■■■□ 3.64
SEMA3B-215ENST00000621029 CNKSR1Q969H4 720 aa37.79■■■■□ 3.64
SEMA3B-215ENST00000621029 SRGNP10124 158 aa37.78■■■■□ 3.64
SEMA3B-215ENST00000621029 GPTP24298 496 aa37.78■■■■□ 3.64
SEMA3B-215ENST00000621029 STYK1Q6J9G0 422 aa37.78■■■■□ 3.64
SEMA3B-215ENST00000621029 MASTLQ96GX5 879 aa37.78■■■■□ 3.64
SEMA3B-215ENST00000621029 C21orf2O43822 256 aa37.77■■■■□ 3.64
SEMA3B-215ENST00000621029 PDIA6Q15084 440 aa37.77■■■■□ 3.64
SEMA3B-215ENST00000621029 PROSER3Q2NL68 480 aa37.77■■■■□ 3.64
SEMA3B-215ENST00000621029 CFAP44Q96MT7 982 aa37.77■■■■□ 3.64
SEMA3B-215ENST00000621029 NYXQ9GZU5 481 aa37.76■■■■□ 3.64
SEMA3B-215ENST00000621029 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
SEMA3B-215ENST00000621029 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
SEMA3B-215ENST00000621029 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
SEMA3B-215ENST00000621029 MRS2Q9HD23 443 aa37.73■■■■□ 3.63
SEMA3B-215ENST00000621029 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa37.72■■■■□ 3.63
SEMA3B-215ENST00000621029 LMNB1P20700 586 aa37.72■■■■□ 3.63
SEMA3B-215ENST00000621029 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
SEMA3B-215ENST00000621029 NUTM1Q86Y26 1132 aa37.72■■■■□ 3.63
SEMA3B-215ENST00000621029 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
SEMA3B-215ENST00000621029 NPR1P16066 1061 aa37.71■■■■□ 3.63
SEMA3B-215ENST00000621029 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa37.71■■■■□ 3.63
SEMA3B-215ENST00000621029 MBIPQ9NS73 344 aa37.71■■■■□ 3.63
SEMA3B-215ENST00000621029 COPS6Q7L5N1 327 aa37.7■■■■□ 3.63
SEMA3B-215ENST00000621029 LRP10Q7Z4F1 713 aa37.7■■■■□ 3.63
SEMA3B-215ENST00000621029 XAGE3Q8WTP9 111 aa37.7■■■■□ 3.63
SEMA3B-215ENST00000621029 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP37.69■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 NFKBIEO00221 500 aa37.68■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 GNAI1P63096 354 aa37.68■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 ERFEQ4G0M1 354 aa37.68■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 IFT57Q9NWB7 429 aa37.68■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 CHPF2Q9P2E5 772 aa37.68■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 UBN2Q6ZU65 1347 aa37.67■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 SUSD4Q5VX71 490 aa37.67■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 DUSP27Q5VZP5 1158 aa37.67■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF34Q8IZ26 560 aa37.67■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 HOXB7P09629 217 aa37.66■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 NUP98P52948 1817 aa37.66■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 KDM2BQ8NHM5 1336 aa37.65■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 SOGA3Q5TF21 947 aa37.65■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa37.65■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 NMRK2Q9NPI5 230 aa37.65■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 KIF3CO14782 793 aa37.64■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 PARP10Q53GL7 1025 aa37.64■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 ABCC12Q96J65 1359 aa37.64■■■■□ 3.62
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF853P0CG23 659 aa37.63■■■■□ 3.61
SEMA3B-215ENST00000621029 PRELPP51888 382 aa37.62■■■■□ 3.61
SEMA3B-215ENST00000621029 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP37.62■■■■□ 3.61
SEMA3B-215ENST00000621029 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
SEMA3B-215ENST00000621029 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa37.61■■■■□ 3.61
SEMA3B-215ENST00000621029 TAOK3Q9H2K8 898 aa37.61■■■■□ 3.61
SEMA3B-215ENST00000621029 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP37.6■■■■□ 3.61
SEMA3B-215ENST00000621029 ALDH1B1P30837 517 aa37.6■■■■□ 3.61
SEMA3B-215ENST00000621029 NTSR2O95665 410 aa37.59■■■■□ 3.61
SEMA3B-215ENST00000621029 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
SEMA3B-215ENST00000621029 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
SEMA3B-215ENST00000621029 SLX4Q8IY92 1834 aa37.59■■■■□ 3.61
SEMA3B-215ENST00000621029 SBF1O95248 1867 aa37.58■■■■□ 3.61
SEMA3B-215ENST00000621029 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC93Q567U6 631 aa37.57■■■■□ 3.6
SEMA3B-215ENST00000621029 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
SEMA3B-215ENST00000621029 HYPKQ9NX55 129 aa37.56■■■■□ 3.6
SEMA3B-215ENST00000621029 CRY2Q49AN0 593 aa37.55■■■■□ 3.6
SEMA3B-215ENST00000621029 RRAGCQ9HB90 399 aa37.55■■■■□ 3.6
SEMA3B-215ENST00000621029 CACNA1SQ13698 1873 aa37.55■■■■□ 3.6
SEMA3B-215ENST00000621029 TCIRG1Q13488 830 aa37.54■■■■□ 3.6
SEMA3B-215ENST00000621029 C7orf43Q8WVR3 580 aa37.54■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms