RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560587.1

ZNF280D-215, Transcript of zinc finger protein 280D, human

TSL 1 (best)

Gene ZNF280D, Length 1,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF280D-215	ENST00000560587	CNBD1	Q8NA66	436 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ZNF280D-215	ENST00000560587	MBIP	Q9NS73	344 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ZNF280D-215	ENST00000560587	GNAI1	P63096	354 aa		32.32	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	KRT24	Q2M2I5	525 aa		32.32	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		32.31	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	ZNF853	P0CG23	659 aa		32.31	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		32.31	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	32.3	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	HOXB7	P09629	217 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	ST5	P78524	1137 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	HLF	Q16534	295 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	PDIA6	Q15084	440 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	NECTIN2	Q92692	538 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	NUP98	P52948	1817 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	CCDC27	Q2M243	656 aa		32.27	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	PROSER3	Q2NL68	480 aa		32.26	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		32.26	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587	ATP10D	Q9P241	1426 aa		32.26	■■■□□ 2.76
ZNF280D-215	ENST00000560587		H0YIN7	160 aa		32.26	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	PDE6B	P35913	854 aa		32.26	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		32.26	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		32.26	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		32.26	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		32.25	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		32.25	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		32.24	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	ANXA1	P04083	346 aa		32.24	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	32.23	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		32.22	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		32.21	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		32.21	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		32.2	■■■□□ 2.75
ZNF280D-215	ENST00000560587	FAM177B	A6PVY3	158 aa		32.19	■■■□□ 2.74
ZNF280D-215	ENST00000560587	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
ZNF280D-215	ENST00000560587	TTLL6	Q8N841	843 aa		32.19	■■■□□ 2.74
ZNF280D-215	ENST00000560587	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
ZNF280D-215	ENST00000560587	COPS6	Q7L5N1	327 aa		32.17	■■■□□ 2.74
ZNF280D-215	ENST00000560587	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		32.17	■■■□□ 2.74
ZNF280D-215	ENST00000560587	NYX	Q9GZU5	481 aa		32.17	■■■□□ 2.74
ZNF280D-215	ENST00000560587	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
ZNF280D-215	ENST00000560587	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
ZNF280D-215	ENST00000560587	GPT	P24298	496 aa		32.16	■■■□□ 2.74
ZNF280D-215	ENST00000560587	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
ZNF280D-215	ENST00000560587	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	32.16	■■■□□ 2.74
ZNF280D-215	ENST00000560587	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		32.15	■■■□□ 2.74
ZNF280D-215	ENST00000560587	ADCY9	O60503	1353 aa		32.15	■■■□□ 2.74
ZNF280D-215	ENST00000560587	IL16	Q14005	1332 aa		32.15	■■■□□ 2.74
ZNF280D-215	ENST00000560587	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		32.15	■■■□□ 2.74
ZNF280D-215	ENST00000560587	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		32.15	■■■□□ 2.74
ZNF280D-215	ENST00000560587	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	SRGN	P10124	158 aa		32.12	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		32.12	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	HYPK	Q9NX55	129 aa		32.12	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	PARP10	Q53GL7	1025 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	STYK1	Q6J9G0	422 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	MASTL	Q96GX5	879 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	CNKSR1	Q969H4	720 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	ABCC12	Q96J65	1359 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	CACNA1S	Q13698	1873 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	SUSD4	Q5VX71	490 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		32.08	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	WDR63	Q8IWG1	891 aa		32.08	■■■□□ 2.73
ZNF280D-215	ENST00000560587	ERFE	Q4G0M1	354 aa		32.07	■■■□□ 2.72
ZNF280D-215	ENST00000560587	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		32.07	■■■□□ 2.72
ZNF280D-215	ENST00000560587	NTSR2	O95665	410 aa		32.06	■■■□□ 2.72
ZNF280D-215	ENST00000560587	NPR1	P16066	1061 aa		32.06	■■■□□ 2.72
ZNF280D-215	ENST00000560587	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ZNF280D-215	ENST00000560587	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ZNF280D-215	ENST00000560587	TSPYL6	Q8N831	410 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ZNF280D-215	ENST00000560587	TCIRG1	Q13488	830 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ZNF280D-215	ENST00000560587	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
ZNF280D-215	ENST00000560587	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ZNF280D-215	ENST00000560587	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
ZNF280D-215	ENST00000560587	SLX4	Q8IY92	1834 aa		32.03	■■■□□ 2.72
ZNF280D-215	ENST00000560587	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		32.02	■■■□□ 2.72
ZNF280D-215	ENST00000560587	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		32.02	■■■□□ 2.72
ZNF280D-215	ENST00000560587	C21orf2	O43822	256 aa		32.01	■■■□□ 2.72
ZNF280D-215	ENST00000560587	NLRP10	Q86W26	655 aa		32.01	■■■□□ 2.72
ZNF280D-215	ENST00000560587	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.72
ZNF280D-215	ENST00000560587	SBF1	O95248	1867 aa		32.01	■■■□□ 2.71

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