RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511587.1

ZBED3-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ZBED3, Length 542 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-203ENST00000511587 NFKBIEO00221 500 aa29.85■■■□□ 2.37
ZBED3-203ENST00000511587 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP29.85■■■□□ 2.37
ZBED3-203ENST00000511587 SRGNP10124 158 aa29.84■■■□□ 2.37
ZBED3-203ENST00000511587 HLFQ16534 295 aa29.84■■■□□ 2.37
ZBED3-203ENST00000511587 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
ZBED3-203ENST00000511587 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
ZBED3-203ENST00000511587 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa29.84■■■□□ 2.37
ZBED3-203ENST00000511587 TIAM2Q8IVF5 1701 aa29.83■■■□□ 2.37
ZBED3-203ENST00000511587 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
ZBED3-203ENST00000511587 NPHP1O15259 732 aa29.83■■■□□ 2.37
ZBED3-203ENST00000511587 LMNB1P20700 586 aa29.83■■■□□ 2.37
ZBED3-203ENST00000511587 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.37
ZBED3-203ENST00000511587 HSPA6P17066 643 aa29.82■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 STYK1Q6J9G0 422 aa29.82■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 CACNA1SQ13698 1873 aa29.82■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa29.82■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 NUP98P52948 1817 aa29.82■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 SLX4Q8IY92 1834 aa29.82■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 TOMM70O94826 608 aa29.81■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 BABAM1Q9NWV8 329 aa29.81■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.81■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 ERVV-1B6SEH8 477 aa29.8■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.8■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 ERBB4Q15303 1308 aa29.79■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 KDM2BQ8NHM5 1336 aa29.79■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 C21orf2O43822 256 aa29.79■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.79■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 CNKSR1Q969H4 720 aa29.79■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 MASTLQ96GX5 879 aa29.79■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa29.78■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 TPTE2Q6XPS3 522 aa29.78■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 TTLL7Q6ZT98 887 aa29.77■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 NGEFQ8N5V2 710 aa29.77■■■□□ 2.36
ZBED3-203ENST00000511587 RUNDC1Q96C34 613 aa29.76■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 LTBP3Q9NS15 1303 aa29.75■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 MYL6BP14649 208 aa29.75■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.75■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 ADAMTS8Q9UP79 889 aa29.74■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.74■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 FAM177BA6PVY3 158 aa29.73■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 NPR1P16066 1061 aa29.73■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 PDIA6Q15084 440 aa29.73■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 KIF6Q6ZMV9 814 aa29.73■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 C7orf43Q8WVR3 580 aa29.72■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 CEP350Q5VT06 3117 aa29.71■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 GLTPD2A6NH11 291 aa29.71■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 NEUROD2Q15784 382 aa29.71■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 ZBTB3Q9H5J0 574 aa29.71■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 RRAGCQ9HB90 399 aa29.71■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 ABCC12Q96J65 1359 aa29.71■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
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ZBED3-203ENST00000511587 SOGA3Q5TF21 947 aa29.7■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 TAOK3Q9H2K8 898 aa29.7■■■□□ 2.35
ZBED3-203ENST00000511587 RIC1Q4ADV7 1423 aa29.7■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 CHL1O00533 1208 aa29.69■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 PROSER3Q2NL68 480 aa29.68■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF34Q8IZ26 560 aa29.68■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 NYXQ9GZU5 481 aa29.68■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 WDR90Q96KV7 1748 aa29.66■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 CRY2Q49AN0 593 aa29.66■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 NUTM1Q86Y26 1132 aa29.66■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 GPTP24298 496 aa29.65■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 ANXA1P04083 346 aa29.64■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 KRT24Q2M2I5 525 aa29.64■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 ERFEQ4G0M1 354 aa29.64■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 CCDC93Q567U6 631 aa29.64■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 SUSD4Q5VX71 490 aa29.64■■■□□ 2.34
ZBED3-203ENST00000511587 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa29.63■■■□□ 2.33
ZBED3-203ENST00000511587 NTSR2O95665 410 aa29.63■■■□□ 2.33
ZBED3-203ENST00000511587 APLP1P51693 650 aa29.63■■■□□ 2.33
ZBED3-203ENST00000511587 FSTL1Q12841 308 aa29.63■■■□□ 2.33
ZBED3-203ENST00000511587 SNED1Q8TER0 1413 aa29.62■■■□□ 2.33
ZBED3-203ENST00000511587 POTECB2RU33 542 aa29.61■■■□□ 2.33
ZBED3-203ENST00000511587 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
ZBED3-203ENST00000511587 ALDH1B1P30837 517 aa29.61■■■□□ 2.33
ZBED3-203ENST00000511587 OLFM4Q6UX06 510 aa29.6■■■□□ 2.33
ZBED3-203ENST00000511587 PARP10Q53GL7 1025 aa29.59■■■□□ 2.33
ZBED3-203ENST00000511587 NECTIN2Q92692 538 aa29.59■■■□□ 2.33
ZBED3-203ENST00000511587 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
ZBED3-203ENST00000511587 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP29.58■■■□□ 2.33
ZBED3-203ENST00000511587 DPY19L2Q6NUT2 758 aa29.58■■■□□ 2.33
ZBED3-203ENST00000511587 CFAP44Q96MT7 982 aa29.58■■■□□ 2.33
ZBED3-203ENST00000511587 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP29.58■■■□□ 2.33
ZBED3-203ENST00000511587 HOXB7P09629 217 aa29.57■■■□□ 2.32
ZBED3-203ENST00000511587 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
ZBED3-203ENST00000511587 COPS6Q7L5N1 327 aa29.57■■■□□ 2.32
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