RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498834.5

VSTM2A-208, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 2

Gene VSTM2A, Length 803 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-208ENST00000498834 PIK3C2AO00443 1686 aa9.44□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.43□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 SLIT2O94813 1529 aa9.43□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.43□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.43□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 IL13P35225 146 aa9.43□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.43□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 POTEAQ6S8J7 498 aa9.43□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 NLRP7Q8WX94 980 aa9.43□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 NBPF4Q96M43 638 aa9.43□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 NFAT5O94916 1531 aa9.42□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.42□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 IRF6O14896 467 aa9.42□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.42□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 BARGINQ6ZT62 677 aa9.42□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.42□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa9.41□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa9.41□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 EXOC5O00471 708 aa9.4□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 IL2RBP14784 551 aa9.4□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 MYT1Q01538 1121 aa9.4□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 LAPTM4AQ15012 233 aa9.4□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.4□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 ATRNO75882 1429 aa9.39□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 CRB1P82279 1406 aa9.39□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 ATP6V1AP38606 617 aa9.39□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 PDE3BQ13370 1112 aa9.39□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 SULT6B1Q6IMI4 303 aa9.39□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.39□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 USHBP1Q8N6Y0 703 aa9.39□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 PHOX2BQ99453 314 aa9.39□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 ADH1BP00325 375 aa9.38□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 GCGRP47871 477 aa9.38□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.38□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 MRS2Q9HD23 443 aa9.38□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.37□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 ABCC6O95255 1503 aa9.37□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 USP54Q70EL1 1684 aa9.37□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 TLL1O43897 1013 aa9.37□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 NEFMP07197 916 aa9.37□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 HMOX1P09601 288 aa9.37□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 FUT2Q10981 343 aa9.37□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 DDB1Q16531 1140 aa9.37□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.37□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 SPG7Q9UQ90 795 aa9.37□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 CCER2I3L3R5 266 aa9.36□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 GFRA3O60609 400 aa9.36□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 AMOTQ4VCS5 1084 aa9.36□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 Q6ZNB5 142 aa9.36□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 SPSB2Q99619 263 aa9.36□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.35□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 RNF223E7ERA6 249 aa9.35□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 S1PR4O95977 384 aa9.35□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.35□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.35□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 CLCN1P35523 988 aa9.34□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 CCDC184Q52MB2 194 aa9.34□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.34□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 CCDC102AQ96A19 550 aa9.34□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.34□□□□□ -0.91
VSTM2A-208ENST00000498834 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa9.34□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 COL18A1P39060 1754 aa9.33□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 PRKAR2BP31323 418 aa9.33□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 SLC19A1P41440 591 aa9.33□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 MORN1Q5T089 497 aa9.33□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.33□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 LMO7Q8WWI1 1683 aa9.32□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 ABCA3Q99758 1704 aa9.32□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 C1orf141Q5JVX7 400 aa9.32□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.32□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 IFNL2Q8IZJ0 200 aa9.32□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.32□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 KDRP35968 1356 aa9.32□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 NWD2Q9ULI1 1742 aa9.31□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
VSTM2A-208ENST00000498834 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms