RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 ADCY9O60503 1353 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD11-202ENST00000498438 NUP98P52948 1817 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD11-202ENST00000498438 NPHP1O15259 732 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD11-202ENST00000498438 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
HOXD11-202ENST00000498438 HLFQ16534 295 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD11-202ENST00000498438 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD11-202ENST00000498438 KRT24Q2M2I5 525 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD11-202ENST00000498438 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD11-202ENST00000498438 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD11-202ENST00000498438 MRS2Q9HD23 443 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD11-202ENST00000498438 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
HOXD11-202ENST00000498438 ATP10DQ9P241 1426 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 CFAP44Q96MT7 982 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 H0YIN7 160 aa24■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 PDE6BP35913 854 aa24■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 ST5P78524 1137 aa24■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 PDIA6Q15084 440 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 PROSER3Q2NL68 480 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 NECTIN2Q92692 538 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 ANXA1P04083 346 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 MBIPQ9NS73 344 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 TTLL6Q8N841 843 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 FAM177BA6PVY3 158 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF853P0CG23 659 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 IFT57Q9NWB7 429 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 HOXB7P09629 217 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 GNAI1P63096 354 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 CACNA1SQ13698 1873 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 GPTP24298 496 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 SBF1O95248 1867 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 SRGNP10124 158 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 SLX4Q8IY92 1834 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 COPS6Q7L5N1 327 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 NYXQ9GZU5 481 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 ABCC12Q96J65 1359 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
HOXD11-202ENST00000498438 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 RASSF7Q02833 373 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 STYK1Q6J9G0 422 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 MASTLQ96GX5 879 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 CCDC27Q2M243 656 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 CNKSR1Q969H4 720 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 WWC1Q8IX03 1113 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 RNF181Q9P0P0 153 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 ERFEQ4G0M1 354 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 SUSD4Q5VX71 490 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 C21orf2O43822 256 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 NTSR2O95665 410 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 NPR1P16066 1061 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 PARP10Q53GL7 1025 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 NFKBIEO00221 500 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
HOXD11-202ENST00000498438 PRELPP51888 382 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD11-202ENST00000498438 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD11-202ENST00000498438 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD11-202ENST00000498438 HYPKQ9NX55 129 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD11-202ENST00000498438 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXD11-202ENST00000498438 LMNB1P20700 586 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXD11-202ENST00000498438 C1QTNF8P60827 252 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXD11-202ENST00000498438 CRY2Q49AN0 593 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXD11-202ENST00000498438 TCIRG1Q13488 830 aa23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms