RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 TXLNAP40222 546 aa8.71□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 AIDAQ96BJ3 306 aa8.71□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 TNFRSF10BO14763 440 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 F11P03951 625 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 ITGA6P23229 1130 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 GMCL1Q96IK5 515 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 STIM2Q9P246 746 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 H3BM21 787 aa8.69□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.69□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 ABTB2Q8N961 1025 aa8.69□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 H7C1W4 665 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 MSX1P28360 303 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 DGKZQ13574 1117 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 ECM1Q16610 540 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 HIF1AQ16665 826 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 MPSTP25325 297 aa8.67□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 ARHGAP4P98171 946 aa8.67□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.67□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 WFS1O76024 890 aa8.66□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 ATP4AP20648 1035 aa8.66□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 VEGFBP49765 207 aa8.66□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.66□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.66□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 PGBD3Q8N328 593 aa8.66□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.66□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 IFT43Q96FT9 208 aa8.66□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 KLK14Q9P0G3 267 aa8.66□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 TREML4Q6UXN2 200 aa8.65□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.65□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 SV2AQ7L0J3 742 aa8.65□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 IRF7Q92985 503 aa8.65□□□□□ -1.02
CCL20-204ENST00000489160 VSIG8P0DPA2 414 aa8.64□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 RGS22Q8NE09 1264 aa8.64□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.64□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 GPAMQ9HCL2 828 aa8.64□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.64□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.64□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 CDC14CA4D256 554 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 EFHC2Q5JST6 749 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 SUSD3Q96L08 255 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 ERCC3P19447 782 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 MAPK1P28482 360 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 AAMPQ13685 434 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 DBN1Q16643 649 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 FAM26DQ5JW98 314 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 IER5Q5VY09 327 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 ZIC5Q96T25 663 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 RUBCNLQ9H714 662 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 BCS1LQ9Y276 419 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB39O15060 712 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 NDUFB5O43674 189 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 NLRP8Q86W28 1048 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 TREML1Q86YW5 311 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PNR3 127 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 MICAL2O94851 1124 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 ZAP70P43403 619 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 FZD6O60353 706 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 KLRG1Q96E93 195 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 CITED4Q96RK1 184 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CCL20-204ENST00000489160 ERBB4Q15303 1308 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 ATCAYQ86WG3 371 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 ASB16Q96NS5 453 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 PHF24Q9UPV7 400 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
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