RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483670.5

PDCD4-208, Transcript of programmed cell death 4, human

TSL 5

Gene PDCD4, Length 774 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDCD4-208	ENST00000483670	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
PDCD4-208	ENST00000483670	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PDCD4-208	ENST00000483670	GPR162	Q16538	588 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PDCD4-208	ENST00000483670	NECTIN2	Q92692	538 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PDCD4-208	ENST00000483670	NUP98	P52948	1817 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PDCD4-208	ENST00000483670	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	HYPK	Q9NX55	129 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	PROSER3	Q2NL68	480 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	33.36	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	ATP10D	Q9P241	1426 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	HLF	Q16534	295 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	MIER1	Q8N108	512 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	NPHP1	O15259	732 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	CNBD1	Q8NA66	436 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	GRIN3B	O60391	1043 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	ANXA1	P04083	346 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	GOLGA2	Q08379	1002 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	COPS6	Q7L5N1	327 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	ZNF521	Q96K83	1311 aa		33.32	■■■□□ 2.93
PDCD4-208	ENST00000483670	ST5	P78524	1137 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670		A0A0G2JLW4	131 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670	DPEP1	P16444	411 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670	PDE6B	P35913	854 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670	TSPYL6	Q8N831	410 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670	NYX	Q9GZU5	481 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670	PIM2	Q9P1W9	311 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PDCD4-208	ENST00000483670	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	33.26	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	PARP10	Q53GL7	1025 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	STK31	Q9BXU1	1019 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	UTRN	P46939	3433 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	CHD4	Q14839	1912 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670		H0YIN7	160 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	KCNA3	P22001	575 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	CACNA1F	O60840	1977 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670		E9PSI1	815 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	CHRNA5	P30532	468 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	GPT	P24298	496 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	TCIRG1	Q13488	830 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	BCS1L	Q9Y276	419 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PDCD4-208	ENST00000483670	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PDCD4-208	ENST00000483670	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
PDCD4-208	ENST00000483670	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PDCD4-208	ENST00000483670	FAM177B	A6PVY3	158 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PDCD4-208	ENST00000483670	VAMP4	O75379	141 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PDCD4-208	ENST00000483670	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PDCD4-208	ENST00000483670	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
PDCD4-208	ENST00000483670	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PDCD4-208	ENST00000483670	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PDCD4-208	ENST00000483670	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PDCD4-208	ENST00000483670	SUSD4	Q5VX71	490 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PDCD4-208	ENST00000483670	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PDCD4-208	ENST00000483670	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
PDCD4-208	ENST00000483670	TTLL6	Q8N841	843 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PDCD4-208	ENST00000483670	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
PDCD4-208	ENST00000483670	NTSR2	O95665	410 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PDCD4-208	ENST00000483670	NLRP10	Q86W26	655 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PDCD4-208	ENST00000483670	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
PDCD4-208	ENST00000483670	SLC4A2	P04920	1241 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PDCD4-208	ENST00000483670	SLFN5	Q08AF3	891 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PDCD4-208	ENST00000483670	STYK1	Q6J9G0	422 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PDCD4-208	ENST00000483670	MASTL	Q96GX5	879 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PDCD4-208	ENST00000483670	SRGN	P10124	158 aa		33.11	■■■□□ 2.89

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