RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482482.1

TBRG4-211, Transcript of transforming growth factor beta regulator 4, humanhuman

TSL 5

Gene TBRG4, Length 486 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4-211ENST00000482482 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.66■■□□□ 1.06
TBRG4-211ENST00000482482 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.66■■□□□ 1.06
TBRG4-211ENST00000482482 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.65■■□□□ 1.06
TBRG4-211ENST00000482482 ST5P78524 1137 aa21.65■■□□□ 1.06
TBRG4-211ENST00000482482 KRT24Q2M2I5 525 aa21.65■■□□□ 1.06
TBRG4-211ENST00000482482 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.65■■□□□ 1.06
TBRG4-211ENST00000482482 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.65■■□□□ 1.06
TBRG4-211ENST00000482482 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.65■■□□□ 1.06
TBRG4-211ENST00000482482 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.65■■□□□ 1.06
TBRG4-211ENST00000482482 ZNF853P0CG23 659 aa21.64■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 GNAI1P63096 354 aa21.64■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 PDIA6Q15084 440 aa21.64■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 NECTIN2Q92692 538 aa21.64■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 MBIPQ9NS73 344 aa21.64■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 IFT57Q9NWB7 429 aa21.64■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 CHD4Q14839 1912 aa21.63■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.63■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 BCORQ6W2J9 1755 aa21.62■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 HOXB7P09629 217 aa21.62■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.62■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.61■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 TTLL6Q8N841 843 aa21.61■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 UTRNP46939 3433 aa21.61■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 FAM177BA6PVY3 158 aa21.6■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 ANXA1P04083 346 aa21.6■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 CCDC27Q2M243 656 aa21.6■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 PROSER3Q2NL68 480 aa21.6■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.6■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.59■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.58■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 COPS6Q7L5N1 327 aa21.58■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 NYXQ9GZU5 481 aa21.58■■□□□ 1.05
TBRG4-211ENST00000482482 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 WWC1Q8IX03 1113 aa21.57■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.57■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 ATP10DQ9P241 1426 aa21.56■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 GPTP24298 496 aa21.56■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.56■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.56■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.56■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 SRGNP10124 158 aa21.55■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 STYK1Q6J9G0 422 aa21.55■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 CNKSR1Q969H4 720 aa21.55■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 MASTLQ96GX5 879 aa21.55■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 ADCY9O60503 1353 aa21.53■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 PARP10Q53GL7 1025 aa21.53■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.53■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 SUSD4Q5VX71 490 aa21.53■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.53■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.53■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 HYPKQ9NX55 129 aa21.53■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.53■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.52■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TBRG4-211ENST00000482482 NPR1P16066 1061 aa21.51■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.51■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.51■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 IL16Q14005 1332 aa21.51■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 C21orf2O43822 256 aa21.5■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 ERFEQ4G0M1 354 aa21.5■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.5■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.49■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 TCIRG1Q13488 830 aa21.49■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.49■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 WDR63Q8IWG1 891 aa21.49■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.49■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 NTSR2O95665 410 aa21.48■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.48■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 RNF181Q9P0P0 153 aa21.48■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.48■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 ALDH1B1P30837 517 aa21.47■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 RASSF7Q02833 373 aa21.47■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 TSPYL6Q8N831 410 aa21.47■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 NUP98P52948 1817 aa21.46■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 SOGA3Q5TF21 947 aa21.46■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 NLRP10Q86W26 655 aa21.46■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 ABCC12Q96J65 1359 aa21.46■■□□□ 1.03
TBRG4-211ENST00000482482 LMNB1P20700 586 aa21.45■■□□□ 1.02
TBRG4-211ENST00000482482 CRY2Q49AN0 593 aa21.45■■□□□ 1.02
TBRG4-211ENST00000482482 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TBRG4-211ENST00000482482 NFKBIEO00221 500 aa21.44■■□□□ 1.02
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