RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 KIF6Q6ZMV9 814 aa27.01■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 SETDB2Q96T68 719 aa27■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa27■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.99■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.913e-7■■■□□ 19.1
NELFE-208ENST00000481121 PDIA6Q15084 440 aa26.99■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.99■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.99■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 CCER2I3L3R5 266 aa26.98■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 ANXA1P04083 346 aa26.98■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 PROSER3Q2NL68 480 aa26.98■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.98■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 IL16Q14005 1332 aa26.98■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 A0A0G2JLW4 131 aa26.97■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 DPEP1P16444 411 aa26.96■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 HLFQ16534 295 aa26.96■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.96■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.95■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 NPHP1O15259 732 aa26.95■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.95■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.95■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 CACNA1SQ13698 1873 aa26.95■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 ATP10DQ9P241 1426 aa26.95■■□□□ 1.91
NELFE-208ENST00000481121 CNBD1Q8NA66 436 aa26.95■■□□□ 1.9
NELFE-208ENST00000481121 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.94■■□□□ 1.9
NELFE-208ENST00000481121 GRIN3BO60391 1043 aa26.94■■□□□ 1.9
NELFE-208ENST00000481121 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.94■■□□□ 1.9
NELFE-208ENST00000481121 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
NELFE-208ENST00000481121 WDR63Q8IWG1 891 aa26.93■■□□□ 1.9
NELFE-208ENST00000481121 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
NELFE-208ENST00000481121 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.92■■□□□ 1.9
NELFE-208ENST00000481121 CHRNA5P30532 468 aa26.91■■□□□ 1.9
NELFE-208ENST00000481121 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
NELFE-208ENST00000481121 ST5P78524 1137 aa26.9■■□□□ 1.9
NELFE-208ENST00000481121 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.9■■□□□ 1.9
NELFE-208ENST00000481121 KCNA3P22001 575 aa26.9■■□□□ 1.9
NELFE-208ENST00000481121 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
NELFE-208ENST00000481121 COPS6Q7L5N1 327 aa26.9■■□□□ 1.9
NELFE-208ENST00000481121 BCS1LQ9Y276 419 aa26.9■■□□□ 1.9
NELFE-208ENST00000481121 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.9■■□□□ 1.9
NELFE-208ENST00000481121 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.89■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 PIM2Q9P1W9 311 aa26.89■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 CACNA1FO60840 1977 aa26.88■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 YY1P25490 414 aa26.88■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.88■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 HYPKQ9NX55 129 aa26.88■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 FAM177BA6PVY3 158 aa26.87■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.87■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 GPTP24298 496 aa26.86■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 PDE6BP35913 854 aa26.86■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.86■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.86■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 TSPYL6Q8N831 410 aa26.86■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.85■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 H0YIN7 160 aa26.85■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.85■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 NYXQ9GZU5 481 aa26.84■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.84■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.83■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.83■■□□□ 1.89
NELFE-208ENST00000481121 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.82■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 ZNF521Q96K83 1311 aa26.81■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 GOLGA2Q08379 1002 aa26.81■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 MIER1Q8N108 512 aa26.81■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 PARP10Q53GL7 1025 aa26.8■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.8■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 LAMB2P55268 1798 aa26.8■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.8■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 ABCC12Q96J65 1359 aa26.79■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 STK31Q9BXU1 1019 aa26.79■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.78■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 SUSD4Q5VX71 490 aa26.78■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.78■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.78■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 TTLL6Q8N841 843 aa26.78■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.885e-7■□□□□ 9.9
NELFE-208ENST00000481121 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 SLX4Q8IY92 1834 aa26.78■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 NTSR2O95665 410 aa26.77■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 TCIRG1Q13488 830 aa26.77■■□□□ 1.88
NELFE-208ENST00000481121 SBF1O95248 1867 aa26.76■■□□□ 1.87
NELFE-208ENST00000481121 SRGNP10124 158 aa26.75■■□□□ 1.87
NELFE-208ENST00000481121 ERFEQ4G0M1 354 aa26.75■■□□□ 1.87
NELFE-208ENST00000481121 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
NELFE-208ENST00000481121 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms