RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 LRP10Q7Z4F1 713 aa31.38■■■□□ 2.61
PTPRD-210ENST00000481079 CNBD1Q8NA66 436 aa31.38■■■□□ 2.61
PTPRD-210ENST00000481079 MYL6BP14649 208 aa31.37■■■□□ 2.61
PTPRD-210ENST00000481079 PDIA6Q15084 440 aa31.37■■■□□ 2.61
PTPRD-210ENST00000481079 TTLL7Q6ZT98 887 aa31.37■■■□□ 2.61
PTPRD-210ENST00000481079 NGEFQ8N5V2 710 aa31.37■■■□□ 2.61
PTPRD-210ENST00000481079 H0YIN7 160 aa31.36■■■□□ 2.61
PTPRD-210ENST00000481079 APAF1O14727 1248 aa31.36■■■□□ 2.61
PTPRD-210ENST00000481079 NUP98P52948 1817 aa31.35■■■□□ 2.61
PTPRD-210ENST00000481079 ERVV-1B6SEH8 477 aa31.35■■■□□ 2.61
PTPRD-210ENST00000481079 PDE6BP35913 854 aa31.35■■■□□ 2.61
PTPRD-210ENST00000481079 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP31.35■■■□□ 2.61
PTPRD-210ENST00000481079 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa31.34■■■□□ 2.61
PTPRD-210ENST00000481079 KRT24Q2M2I5 525 aa31.34■■■□□ 2.61
PTPRD-210ENST00000481079 TTLL6Q8N841 843 aa31.34■■■□□ 2.61
PTPRD-210ENST00000481079 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
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PTPRD-210ENST00000481079 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
PTPRD-210ENST00000481079 ST5P78524 1137 aa31.32■■■□□ 2.6
PTPRD-210ENST00000481079 PROSER3Q2NL68 480 aa31.32■■■□□ 2.6
PTPRD-210ENST00000481079 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
PTPRD-210ENST00000481079 CFAP44Q96MT7 982 aa31.31■■■□□ 2.6
PTPRD-210ENST00000481079 SBF1O95248 1867 aa31.29■■■□□ 2.6
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF853P0CG23 659 aa31.29■■■□□ 2.6
PTPRD-210ENST00000481079 KIF6Q6ZMV9 814 aa31.29■■■□□ 2.6
PTPRD-210ENST00000481079 NPHP1O15259 732 aa31.28■■■□□ 2.6
PTPRD-210ENST00000481079 ANXA1P04083 346 aa31.28■■■□□ 2.6
PTPRD-210ENST00000481079 ZBTB3Q9H5J0 574 aa31.28■■■□□ 2.6
PTPRD-210ENST00000481079 SRGNP10124 158 aa31.27■■■□□ 2.6
PTPRD-210ENST00000481079 TPTE2Q6XPS3 522 aa31.27■■■□□ 2.6
PTPRD-210ENST00000481079 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 ANP32CO43423 234 aa31.26■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 C9orf131Q5VYM1 1079 aa31.26■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP31.26■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 MBIPQ9NS73 344 aa31.26■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 NECTIN2Q92692 538 aa31.25■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa31.25■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 UBN2Q6ZU65 1347 aa31.24■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 FAM177BA6PVY3 158 aa31.24■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 C1QTNF8P60827 252 aa31.24■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 STYK1Q6J9G0 422 aa31.24■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
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PTPRD-210ENST00000481079 RASSF7Q02833 373 aa31.23■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF34Q8IZ26 560 aa31.23■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 IFT57Q9NWB7 429 aa31.23■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 SLX4Q8IY92 1834 aa31.23■■■□□ 2.59
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PTPRD-210ENST00000481079 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP31.22■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 CACNA1SQ13698 1873 aa31.21■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 MRS2Q9HD23 443 aa31.21■■■□□ 2.59
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PTPRD-210ENST00000481079 GPTP24298 496 aa31.2■■■□□ 2.59
PTPRD-210ENST00000481079 RNF181Q9P0P0 153 aa31.2■■■□□ 2.59
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PTPRD-210ENST00000481079 COPS6Q7L5N1 327 aa31.19■■■□□ 2.58
PTPRD-210ENST00000481079 CNKSR1Q969H4 720 aa31.19■■■□□ 2.58
PTPRD-210ENST00000481079 CHPF2Q9P2E5 772 aa31.19■■■□□ 2.58
PTPRD-210ENST00000481079 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa31.18■■■□□ 2.58
PTPRD-210ENST00000481079 C21orf2O43822 256 aa31.18■■■□□ 2.58
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PTPRD-210ENST00000481079 SUSD4Q5VX71 490 aa31.18■■■□□ 2.58
PTPRD-210ENST00000481079 DUSP27Q5VZP5 1158 aa31.18■■■□□ 2.58
PTPRD-210ENST00000481079 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
PTPRD-210ENST00000481079 NUTM1Q86Y26 1132 aa31.18■■■□□ 2.58
PTPRD-210ENST00000481079 XAGE3Q8WTP9 111 aa31.18■■■□□ 2.58
PTPRD-210ENST00000481079 NYXQ9GZU5 481 aa31.18■■■□□ 2.58
PTPRD-210ENST00000481079 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa31.16■■■□□ 2.58
PTPRD-210ENST00000481079 NPR1P16066 1061 aa31.16■■■□□ 2.58
PTPRD-210ENST00000481079 ERFEQ4G0M1 354 aa31.16■■■□□ 2.58
PTPRD-210ENST00000481079 RIC1Q4ADV7 1423 aa31.15■■■□□ 2.58
PTPRD-210ENST00000481079 NTSR2O95665 410 aa31.15■■■□□ 2.58
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PTPRD-210ENST00000481079 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
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PTPRD-210ENST00000481079 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa31.14■■■□□ 2.58
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PTPRD-210ENST00000481079 LMNB1P20700 586 aa31.14■■■□□ 2.58
PTPRD-210ENST00000481079 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
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PTPRD-210ENST00000481079 C7orf43Q8WVR3 580 aa31.14■■■□□ 2.58
PTPRD-210ENST00000481079 PARP10Q53GL7 1025 aa31.12■■■□□ 2.57
PTPRD-210ENST00000481079 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
PTPRD-210ENST00000481079 WWC1Q8IX03 1113 aa31.11■■■□□ 2.57
PTPRD-210ENST00000481079 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
PTPRD-210ENST00000481079 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
PTPRD-210ENST00000481079 C8orf58Q8NAV2 365 aa31.1■■■□□ 2.57
PTPRD-210ENST00000481079 TIAM2Q8IVF5 1701 aa31.1■■■□□ 2.57
PTPRD-210ENST00000481079 LTBP3Q9NS15 1303 aa31.09■■■□□ 2.57
PTPRD-210ENST00000481079 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa31.09■■■□□ 2.57
PTPRD-210ENST00000481079 NMRK2Q9NPI5 230 aa31.08■■■□□ 2.57
PTPRD-210ENST00000481079 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
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