RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 KRT24Q2M2I5 525 aa24.52■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.51■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 ATP10DQ9P241 1426 aa24.51■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 HYPKQ9NX55 129 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 CNBD1Q8NA66 436 aa24.48■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.48■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 DPEP1P16444 411 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 ST5P78524 1137 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 PDE6BP35913 854 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 HLFQ16534 295 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 PROSER3Q2NL68 480 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 NYXQ9GZU5 481 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 PIM2Q9P1W9 311 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-203ENST00000474160 A0A0G2JLW4 131 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 NPHP1O15259 732 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 COPS6Q7L5N1 327 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 NECTIN2Q92692 538 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 NUP98P52948 1817 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 KCNA3P22001 575 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 PARP10Q53GL7 1025 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 ZNF521Q96K83 1311 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 GOLGA2Q08379 1002 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 H0YIN7 160 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 ANXA1P04083 346 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 CHD4Q14839 1912 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.41■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.4■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.4■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 UTRNP46939 3433 aa24.39■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.39■■□□□ 1.5
SYF2-203ENST00000474160 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.39■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 TSPYL6Q8N831 410 aa24.39■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 STK31Q9BXU1 1019 aa24.39■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 BCS1LQ9Y276 419 aa24.39■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.39■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.38■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 CHRNA5P30532 468 aa24.38■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 YY1P25490 414 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 TCIRG1Q13488 830 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.37■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 TTLL6Q8N841 843 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 STYK1Q6J9G0 422 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 MIER1Q8N108 512 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 E9PSI1 815 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 GPTP24298 496 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 CNKSR1Q969H4 720 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 MASTLQ96GX5 879 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 NTSR2O95665 410 aa24.33■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 SRGNP10124 158 aa24.33■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 SUSD4Q5VX71 490 aa24.33■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SYF2-203ENST00000474160 VAMP4O75379 141 aa24.32■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 CACNA1FO60840 1977 aa24.32■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 NPR1P16066 1061 aa24.31■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.31■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 NLRP10Q86W26 655 aa24.31■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.31■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 FAM177BA6PVY3 158 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 302.8 ms