RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469056.1

PARL-209, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 3

Gene PARL, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-209ENST00000469056 CNBD1Q8NA66 436 aa15.52■□□□□ 0.08
PARL-209ENST00000469056 MBIPQ9NS73 344 aa15.52■□□□□ 0.08
PARL-209ENST00000469056 PIM2Q9P1W9 311 aa15.52■□□□□ 0.08
PARL-209ENST00000469056 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.51■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.51■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 ZNF853P0CG23 659 aa15.51■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 ST5P78524 1137 aa15.51■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 CCDC27Q2M243 656 aa15.51■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 KRT24Q2M2I5 525 aa15.51■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 PRR5LQ6MZQ0 368 aa15.51■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.51■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 PDIA6Q15084 440 aa15.5■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 HLFQ16534 295 aa15.5■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.5■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 NECTIN2Q92692 538 aa15.5■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 BRIP1Q9BX63 1249 aa15.5■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa15.5■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa15.5■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 NUP98P52948 1817 aa15.5■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa15.5■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 DLEC1Q9Y238 1755 aa15.49■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 PDE6BP35913 854 aa15.49■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.49■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 LRP10Q7Z4F1 713 aa15.49■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 C2CD5Q86YS7 1000 aa15.49■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 ATP10DQ9P241 1426 aa15.49■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 H0YIN7 160 aa15.48■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 ANXA1P04083 346 aa15.48■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 PROSER3Q2NL68 480 aa15.48■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 WWC1Q8IX03 1113 aa15.48■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 CCDC24Q8N4L8 307 aa15.48■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.48■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.47■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.47■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.47■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 TTLL6Q8N841 843 aa15.46■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.46■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PARL-209ENST00000469056 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 IL16Q14005 1332 aa15.45■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 FAM177BA6PVY3 158 aa15.45■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa15.45■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 COPS6Q7L5N1 327 aa15.45■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.45■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 NYXQ9GZU5 481 aa15.45■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 GPTP24298 496 aa15.44■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.44■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.43■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 PARP10Q53GL7 1025 aa15.43■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.43■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.43■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 C8orf58Q8NAV2 365 aa15.43■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 HYPKQ9NX55 129 aa15.43■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 ADCY9O60503 1353 aa15.43■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.42■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 SRGNP10124 158 aa15.42■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 STYK1Q6J9G0 422 aa15.42■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 WDR63Q8IWG1 891 aa15.42■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 MASTLQ96GX5 879 aa15.42■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 ABCC12Q96J65 1359 aa15.41■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 SUSD4Q5VX71 490 aa15.41■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa15.41■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 CNKSR1Q969H4 720 aa15.41■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 CCDC30Q5VVM6 783 aa15.4■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 NUTM1Q86Y26 1132 aa15.4■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.4■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 RIC1Q4ADV7 1423 aa15.4■□□□□ 0.06
PARL-209ENST00000469056 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa15.39■□□□□ 0.05
PARL-209ENST00000469056 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PARL-209ENST00000469056 NTSR2O95665 410 aa15.39■□□□□ 0.05
PARL-209ENST00000469056 NPR1P16066 1061 aa15.39■□□□□ 0.05
PARL-209ENST00000469056 TCIRG1Q13488 830 aa15.39■□□□□ 0.05
PARL-209ENST00000469056 ERFEQ4G0M1 354 aa15.39■□□□□ 0.05
PARL-209ENST00000469056 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.39■□□□□ 0.05
PARL-209ENST00000469056 TSPYL6Q8N831 410 aa15.39■□□□□ 0.05
PARL-209ENST00000469056 CACNA1SQ13698 1873 aa15.39■□□□□ 0.05
PARL-209ENST00000469056 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.39■□□□□ 0.05
PARL-209ENST00000469056 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.39■□□□□ 0.05
PARL-209ENST00000469056 GOLGA2Q08379 1002 aa15.38■□□□□ 0.05
PARL-209ENST00000469056 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PARL-209ENST00000469056 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PARL-209ENST00000469056 CCER2I3L3R5 266 aa15.37■□□□□ 0.05
PARL-209ENST00000469056 C21orf2O43822 256 aa15.37■□□□□ 0.05
PARL-209ENST00000469056 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PARL-209ENST00000469056 C9orf131Q5VYM1 1079 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms