RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468358.5

CLDN11-202, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 3

Gene CLDN11, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-202ENST00000468358 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.49■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.49■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 WWC1Q8IX03 1113 aa22.49■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.48■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.48■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 BCS1LQ9Y276 419 aa22.48■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.48■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 FAM177BA6PVY3 158 aa22.47■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 HOXB7P09629 217 aa22.47■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 CHRNA5P30532 468 aa22.47■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 HLFQ16534 295 aa22.47■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 PROSER3Q2NL68 480 aa22.47■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.47■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 CNBD1Q8NA66 436 aa22.47■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 NUP98P52948 1817 aa22.47■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 PDIA6Q15084 440 aa22.46■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.46■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.46■■□□□ 1.19
CLDN11-202ENST00000468358 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.45■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 ST5P78524 1137 aa22.45■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 PIM2Q9P1W9 311 aa22.45■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 RGL2O15211 777 aa22.44■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.43■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.43■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 H0YIN7 160 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 GPTP24298 496 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 COPS6Q7L5N1 327 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 IL16Q14005 1332 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 KCNA3P22001 575 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 PDE6BP35913 854 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 UTRNP46939 3433 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 ATP10DQ9P241 1426 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN11-202ENST00000468358 CCER2I3L3R5 266 aa22.39■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 WDR63Q8IWG1 891 aa22.39■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.38■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 HYPKQ9NX55 129 aa22.38■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.38■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 NYXQ9GZU5 481 aa22.37■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.37■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.36■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.36■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.36■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 TSPYL6Q8N831 410 aa22.36■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.35■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.35■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 TTLL6Q8N841 843 aa22.35■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 CACNA1SQ13698 1873 aa22.34■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.34■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.34■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.34■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 PARP10Q53GL7 1025 aa22.33■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.33■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.33■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 STK31Q9BXU1 1019 aa22.33■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.33■■□□□ 1.17
CLDN11-202ENST00000468358 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 GOLGA2Q08379 1002 aa22.32■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 SUSD4Q5VX71 490 aa22.32■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.32■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 ERFEQ4G0M1 354 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 ABCC12Q96J65 1359 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 TCIRG1Q13488 830 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 MASTLQ96GX5 879 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 NTSR2O95665 410 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 SRGNP10124 158 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 STYK1Q6J9G0 422 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 MIER1Q8N108 512 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 CNKSR1Q969H4 720 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CLDN11-202ENST00000468358 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms