RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.94■■□□□ 1.9
VARS-218ENST00000459667 CHD4Q14839 1912 aa26.94■■□□□ 1.9
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VARS-218ENST00000459667 ANXA1P04083 346 aa26.93■■□□□ 1.9
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VARS-218ENST00000459667 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.93■■□□□ 1.9
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VARS-218ENST00000459667 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.87■■□□□ 1.89
VARS-218ENST00000459667 ATP10DQ9P241 1426 aa26.87■■□□□ 1.89
VARS-218ENST00000459667 CCER2I3L3R5 266 aa26.86■■□□□ 1.89
VARS-218ENST00000459667 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.86■■□□□ 1.89
VARS-218ENST00000459667 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
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VARS-218ENST00000459667 COPS6Q7L5N1 327 aa26.85■■□□□ 1.89
VARS-218ENST00000459667 WDR63Q8IWG1 891 aa26.85■■□□□ 1.89
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VARS-218ENST00000459667 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.85■■□□□ 1.89
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VARS-218ENST00000459667 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.84■■□□□ 1.89
VARS-218ENST00000459667 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.83■■□□□ 1.89
VARS-218ENST00000459667 PDE6BP35913 854 aa26.83■■□□□ 1.89
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VARS-218ENST00000459667 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
VARS-218ENST00000459667 H0YIN7 160 aa26.82■■□□□ 1.88
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VARS-218ENST00000459667 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.82■■□□□ 1.88
VARS-218ENST00000459667 HYPKQ9NX55 129 aa26.81■■□□□ 1.88
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VARS-218ENST00000459667 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
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VARS-218ENST00000459667 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.75■■□□□ 1.87
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VARS-218ENST00000459667 ABCC12Q96J65 1359 aa26.74■■□□□ 1.87
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VARS-218ENST00000459667 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.74■■□□□ 1.87
VARS-218ENST00000459667 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
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VARS-218ENST00000459667 CACNA1SQ13698 1873 aa26.71■■□□□ 1.87
VARS-218ENST00000459667 STYK1Q6J9G0 422 aa26.71■■□□□ 1.87
VARS-218ENST00000459667 MASTLQ96GX5 879 aa26.71■■□□□ 1.87
VARS-218ENST00000459667 STK31Q9BXU1 1019 aa26.71■■□□□ 1.87
VARS-218ENST00000459667 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
VARS-218ENST00000459667 CNKSR1Q969H4 720 aa26.7■■□□□ 1.86
VARS-218ENST00000459667 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
VARS-218ENST00000459667 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.7■■□□□ 1.86
VARS-218ENST00000459667 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
VARS-218ENST00000459667 NLRP10Q86W26 655 aa26.69■■□□□ 1.86
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